! Topology file for hydrogenase-related clusters 31 1 !Random version number ! Oxidized [2Fe-2S] resname F2O MASS 1 FEKO 55.84700 MASS 2 SKO 32.06600 ! Reduced [2Fe-2S] resname F2R MASS 3 FEKR 55.84700 MASS 4 SKR 32.06600 ! [4Fe-4S]2+ resname F4O MASS 5 FEJO 55.84700 ! MASS 6 SJO 32.06600 ! ! [4Fe-4S]1+ resname F4R MASS 7 FEJR 55.84700 ! MASS 8 SJR 32.06600 ! ! [4Fe-4S]2+-HSD resname FHO MASS 9 FEIO 55.84700 ! MASS 10 SIO 32.06600 ! ! [4Fe-4S]2+-HSD resname FHO MASS 11 FEIR 55.84700 ! MASS 12 SIR 32.06600 ! ! Semi-reduced FeIFeII H-cluster resname HCO MASS 13 FEM1 55.84700 ! Fe bound to hydrogenase cysteine MASS 14 FEM2 55.84700 ! Fe not bound to cysteine, bound to hydride MASS 15 SM1 32.06600 ! DTMA sulfur at right angle to Fe1 CN carbon MASS 16 SM2 32.06600 ! DTMA sulfur trans to Fe1 CN carbon MASS 17 NMM 14.00700 ! DTMA nitrogen :(S^-)-CH2-NH-CH2-(S^-): MASS 18 OM4 15.99900 ! Terminal Fe-bound carbonyl O MASS 19 NM5 14.00700 ! Terminal Fe-bound cyanide N MASS 20 OM6 15.99900 ! Bridging Fe-bound carbonyl O MASS 21 CMO1 12.01100 ! Terminal Fe1-bound carbonyl C MASS 22 CMN1 12.01100 ! Terminal Fe1-bound cyanide C MASS 23 CMO2 12.01100 ! Terminal Fe2-bound carbonyl O MASS 24 CMN2 12.01100 ! Terminal Fe2-bound cyanide N MASS 25 CMC 12.01100 ! Bridging Fe-bound carbonyl CO MASS 26 HCM1 1.00800 ! Hydrogen of DTMA bridge facing cysteine MASS 27 HCM2 1.00800 ! Hydrogen of DTMA bridge opposing cysteine MASS 28 CCM1 12.01100 ! DTMA carbons ! Reduced FeIFeI H-cluster with hydride resname HCR MASS 29 FEL1 55.84700 ! Fe bound to hydrogenase cysteine MASS 30 FEL2 55.84700 ! Fe not bound to cysteine, bound to hydride MASS 31 SL1 32.06600 ! DTMA sulfur trans to distal Fe2 CN MASS 32 SL2 32.06600 ! DTMA sulfur trans to proximal Fe1 CN MASS 33 NLM 15.01500 ! DTMA nitrogen :(S^-)-CH2-NH-CH2-(S^-): MASS 34 OL4 15.99900 ! Terminal Fe-bound carbonyl O MASS 35 NL5 14.00700 ! Terminal Fe-bound cyanide N MASS 36 OL6 15.99900 ! Bridging Fe-bound carbonyl O MASS 37 CLO1 12.01100 ! Terminal Fe1-bound carbonyl C MASS 38 CLN1 12.01100 ! Terminal Fe1-bound cyanide C MASS 39 CLO2 12.01100 ! Terminal Fe2-bound carbonyl O MASS 40 CLN2 12.01100 ! Terminal Fe2-bound cyanide N MASS 41 CLC 12.01100 ! Bridging Fe-bound carbonyl C MASS 42 HH 1.00800 ! Fe-bound hydride MASS 43 HCL1 1.00800 ! Hydrogen of DTMA bridge facing proximal side MASS 44 HCL2 1.00800 ! Hydrogen of DTMA bridge facing distal side MASS 45 CCL1 12.01100 ! DTMA carbons !!! Oxidized [2Fe2S] cluster segment HYDE RESI F2O 0.02804 ! GROUP ATOM FE1 FEKO 0.56889 ATOM FE2 FEKO 0.56889 ATOM S1 SKO -0.55487 ATOM S2 SKO -0.55487 BOND FE1 S1 FE1 S2 FE2 S1 FE2 S2 ANGL S1 FE1 S2 S1 FE2 S2 FE1 S1 FE2 ANGL FE1 S2 FE2 DIHE S1 FE1 S2 FE2 S2 FE2 S1 FE1 !!! Reduced [2Fe2S] cluster segment HYDE RESI F2R -0.75088 ! GROUP ATOM FE1 FEKR 0.20787 ATOM FE2 FEKR 0.20787 ATOM S1 SKR -0.58330 ATOM S2 SKR -0.58330 BOND FE1 S1 FE1 S2 FE2 S1 FE2 S2 ANGL S1 FE1 S2 S1 FE2 S2 FE1 S1 FE2 ANGL FE1 S2 FE2 DIHE S1 FE1 S2 FE2 !!! Oxidized [4Fe4S] cluster segments HYDA, HYDB, HYDC RESI F4O 0.54050 ! GROUP ATOM FE1 FEJO 1.10417 ATOM FE2 FEJO 1.10417 ATOM FE3 FEJO 1.10417 ATOM FE4 FEJO 1.10417 ATOM S1 SJO -0.96905 ATOM S2 SJO -0.96905 ATOM S3 SJO -0.96905 ATOM S4 SJO -0.96905 BOND FE1 S1 FE1 S2 FE1 S3 FE2 S1 BOND FE2 S2 FE2 S4 FE3 S2 FE3 S3 BOND FE3 S4 FE4 S1 FE4 S3 FE4 S4 BOND FE1 FE2 FE1 FE3 FE1 FE4 FE2 FE3 BOND FE2 FE4 FE3 FE4 ANGL FE1 S3 FE4 FE1 S3 FE3 S4 FE2 FE1 ANGL FE1 S2 FE3 FE1 S2 FE2 FE1 S1 FE4 ANGL FE1 S1 FE2 FE1 FE4 FE3 FE1 FE4 FE2 ANGL FE1 FE3 FE4 FE1 FE3 FE2 FE1 FE2 FE4 ANGL FE1 FE2 FE3 FE2 S4 FE4 FE2 S4 FE3 ANGL FE2 S2 FE3 FE2 S1 FE4 FE2 FE4 FE3 ANGL FE2 FE3 FE4 FE2 FE1 FE4 FE2 FE1 FE3 ANGL FE3 S4 FE4 FE3 S3 FE4 FE3 FE2 FE4 ANGL FE3 FE1 FE4 S1 FE4 FE3 S1 FE4 FE2 ANGL S1 FE4 FE1 S1 FE4 S4 S1 FE4 S3 ANGL S1 FE2 FE4 S1 FE2 FE3 S1 FE2 FE1 ANGL S1 FE2 S4 S1 FE2 S2 S1 FE1 FE4 ANGL S1 FE1 FE3 S1 FE1 FE2 S1 FE1 S3 ANGL S1 FE1 S2 S2 FE3 FE4 S2 FE3 FE2 ANGL S2 FE3 FE1 S2 FE3 S4 S2 FE3 S3 ANGL S2 FE2 FE4 S2 FE2 FE3 S2 FE2 FE1 ANGL S2 FE2 S4 S2 FE1 FE4 S2 FE1 FE3 ANGL S2 FE1 FE2 S2 FE1 S3 S3 FE4 FE3 ANGL S3 FE4 FE2 S3 FE4 FE1 S3 FE4 S4 ANGL S3 FE3 FE4 S3 FE3 FE2 S3 FE3 FE1 ANGL S3 FE3 S4 S3 FE1 FE4 S3 FE1 FE3 ANGL S3 FE1 FE2 S4 FE4 FE3 S4 FE4 FE2 ANGL S4 FE4 FE1 S4 FE3 FE4 S4 FE3 FE2 ANGL S4 FE3 FE1 S4 FE2 FE4 S4 FE2 FE3 DIHE FE1 S3 FE3 FE2 FE1 S3 FE3 FE4 DIHE FE1 S3 FE4 FE2 FE1 S3 FE4 FE3 DIHE FE1 S2 FE2 FE3 FE1 S2 FE2 FE4 DIHE FE1 S2 FE3 FE2 FE1 S2 FE3 FE4 DIHE FE1 S1 FE2 FE3 FE1 S1 FE2 FE4 DIHE FE1 S1 FE4 FE2 FE1 FE2 FE4 FE3 DIHE FE1 S1 FE4 FE3 FE1 FE4 S1 FE2 DIHE FE1 FE4 S3 FE3 FE1 FE4 S4 FE2 DIHE FE1 FE4 S4 FE3 FE1 FE4 FE2 S1 DIHE FE1 FE4 FE2 S2 FE1 FE4 FE2 S4 DIHE FE1 FE4 FE2 FE3 FE1 FE4 FE3 S2 DIHE FE1 FE4 FE3 S3 FE1 FE4 FE3 S4 DIHE FE1 FE4 FE3 FE2 FE1 FE3 S2 FE2 DIHE FE1 FE3 S3 FE4 FE1 FE3 S4 FE2 DIHE FE1 FE3 S4 FE4 FE1 FE3 FE2 S1 DIHE FE1 FE3 FE2 S2 FE1 FE3 FE2 S4 DIHE FE1 FE3 FE2 FE4 FE1 FE3 FE4 S1 DIHE FE1 FE3 FE4 S3 FE1 FE3 FE4 S4 DIHE FE1 FE3 FE4 FE2 FE1 FE2 S1 FE4 DIHE FE1 FE2 S2 FE3 FE1 FE2 S4 FE3 DIHE FE1 FE2 S4 FE4 FE1 FE2 FE3 S2 DIHE FE1 FE2 FE3 S3 FE1 FE2 FE3 S4 DIHE FE1 FE2 FE3 FE4 FE1 FE2 FE4 S1 DIHE FE1 FE2 FE4 S3 FE1 FE2 FE4 S4 DIHE FE2 S4 FE3 FE4 FE2 S4 FE4 FE3 DIHE FE2 S2 FE1 FE3 FE2 S2 FE1 FE4 DIHE FE2 S2 FE3 FE4 FE2 FE1 FE4 FE3 DIHE FE2 S1 FE1 FE3 FE2 S1 FE1 FE4 DIHE FE2 S1 FE4 FE3 FE2 FE4 S3 FE3 DIHE FE2 FE4 S4 FE3 FE2 FE4 FE1 S1 DIHE FE2 FE4 FE1 S2 FE2 FE4 FE1 S3 DIHE FE2 FE4 FE1 FE3 FE2 FE4 FE3 S2 DIHE FE2 FE4 FE3 S3 FE2 FE4 FE3 S4 DIHE FE2 FE3 S3 FE4 FE2 FE3 S4 FE4 DIHE FE2 FE3 FE1 S1 FE2 FE3 FE1 S2 DIHE FE2 FE3 FE1 S3 FE2 FE3 FE1 FE4 DIHE FE2 FE3 FE4 S1 FE2 FE3 FE4 S3 DIHE FE2 FE3 FE4 S4 FE2 FE1 S1 FE4 DIHE FE2 FE1 S2 FE3 FE2 FE1 S3 FE3 DIHE FE2 FE1 S3 FE4 FE2 FE1 FE3 S2 DIHE FE2 FE1 FE3 S3 FE2 FE1 FE3 S4 DIHE FE2 FE1 FE3 FE4 FE2 FE1 FE4 S1 DIHE FE2 FE1 FE4 S3 FE2 FE1 FE4 S4 DIHE FE3 S4 FE2 FE4 FE3 S3 FE1 FE4 DIHE FE3 S2 FE1 FE4 DIHE FE3 S2 FE2 FE4 FE3 FE4 FE1 S1 DIHE FE3 FE4 FE1 S2 FE3 FE4 FE1 S3 DIHE FE3 FE4 FE2 S1 FE3 FE4 FE2 S2 DIHE FE3 FE4 FE2 S4 FE3 FE2 S1 FE4 DIHE FE3 FE2 S4 FE4 FE3 FE2 FE1 S1 DIHE FE3 FE2 FE1 S2 FE3 FE2 FE1 S3 DIHE FE3 FE2 FE1 FE4 FE3 FE2 FE4 S1 DIHE FE3 FE2 FE4 S3 FE3 FE2 FE4 S4 DIHE FE3 FE1 S1 FE4 FE3 FE1 S3 FE4 DIHE FE3 FE1 FE2 S1 FE3 FE1 FE2 S2 DIHE FE3 FE1 FE2 S4 FE3 FE1 FE2 FE4 DIHE FE3 FE1 FE4 S1 FE3 FE1 FE4 S3 DIHE FE3 FE1 FE4 S4 FE4 FE3 FE1 S1 DIHE FE4 FE3 FE1 S2 FE4 FE3 FE1 S3 DIHE FE4 FE3 FE2 S1 FE4 FE3 FE2 S2 DIHE FE4 FE3 FE2 S4 FE4 FE2 FE1 S1 DIHE FE4 FE2 FE1 S2 FE4 FE2 FE1 S3 DIHE FE4 FE2 FE3 S2 FE4 FE2 FE3 S3 DIHE FE4 FE2 FE3 S4 FE4 FE1 FE2 S1 DIHE FE4 FE1 FE2 S2 FE4 FE1 FE2 S4 DIHE FE4 FE1 FE3 S2 FE4 FE1 FE3 S3 DIHE FE4 FE1 FE3 S4 S1 FE4 FE1 S2 DIHE S1 FE4 FE1 S3 S1 FE4 FE2 S2 DIHE S1 FE4 FE2 S4 S1 FE4 FE3 S2 DIHE S1 FE4 FE3 S3 S1 FE4 FE3 S4 DIHE S1 FE2 FE1 S2 S1 FE2 FE1 S3 DIHE S1 FE2 FE3 S2 S1 FE2 FE3 S3 DIHE S1 FE2 FE3 S4 S1 FE2 FE4 S3 DIHE S1 FE2 FE4 S4 S1 FE1 FE2 S2 DIHE S1 FE1 FE2 S4 S1 FE1 FE3 S2 DIHE S1 FE1 FE3 S3 S1 FE1 FE3 S4 DIHE S1 FE1 FE4 S3 S1 FE1 FE4 S4 DIHE S2 FE3 FE1 S3 S2 FE3 FE2 S4 DIHE S2 FE3 FE4 S3 S2 FE3 FE4 S4 DIHE S2 FE2 FE1 S3 S2 FE2 FE3 S3 DIHE S2 FE2 FE3 S4 S2 FE2 FE4 S3 DIHE S2 FE2 FE4 S4 S2 FE1 FE2 S4 DIHE S2 FE1 FE3 S3 S2 FE1 FE3 S4 DIHE S2 FE1 FE4 S3 S2 FE1 FE4 S4 DIHE S3 FE4 FE2 S4 S3 FE4 FE3 S4 DIHE S3 FE3 FE2 S4 S3 FE3 FE4 S4 DIHE S3 FE1 FE2 S4 S3 FE1 FE3 S4 DIHE S3 FE1 FE4 S4 !!! Reduced [4Fe4S] cluster segments HYDA, HYDB, HYDC RESI F4R 0.11936 ! GROUP ATOM FE1 FEJR 1.16332 ATOM FE2 FEJR 1.16332 ATOM FE3 FEJR 1.16332 ATOM FE4 FEJR 1.16332 ATOM S1 SJR -1.13348 ATOM S2 SJR -1.13348 ATOM S3 SJR -1.13348 ATOM S4 SJR -1.13348 BOND FE1 S1 FE1 S2 FE1 S3 FE2 S1 BOND FE2 S2 FE2 S4 FE3 S2 FE3 S3 BOND FE3 S4 FE4 S1 FE4 S3 FE4 S4 BOND FE1 FE2 FE1 FE3 FE1 FE4 FE2 FE3 BOND FE2 FE4 FE3 FE4 ANGL FE1 S3 FE4 FE1 S3 FE3 S4 FE2 FE1 ANGL FE1 S2 FE3 FE1 S2 FE2 FE1 S1 FE4 ANGL FE1 S1 FE2 FE1 FE4 FE3 FE1 FE4 FE2 ANGL FE1 FE3 FE4 FE1 FE3 FE2 FE1 FE2 FE4 ANGL FE1 FE2 FE3 FE2 S4 FE4 FE2 S4 FE3 ANGL FE2 S2 FE3 FE2 S1 FE4 FE2 FE4 FE3 ANGL FE2 FE3 FE4 FE2 FE1 FE4 FE2 FE1 FE3 ANGL FE3 S4 FE4 FE3 S3 FE4 FE3 FE2 FE4 ANGL FE3 FE1 FE4 S1 FE4 FE3 S1 FE4 FE2 ANGL S1 FE4 FE1 S1 FE4 S4 S1 FE4 S3 ANGL S1 FE2 FE4 S1 FE2 FE3 S1 FE2 FE1 ANGL S1 FE2 S4 S1 FE2 S2 S1 FE1 FE4 ANGL S1 FE1 FE3 S1 FE1 FE2 S1 FE1 S3 ANGL S1 FE1 S2 S2 FE3 FE4 S2 FE3 FE2 ANGL S2 FE3 FE1 S2 FE3 S4 S2 FE3 S3 ANGL S2 FE2 FE4 S2 FE2 FE3 S2 FE2 FE1 ANGL S2 FE2 S4 S2 FE1 FE4 S2 FE1 FE3 ANGL S2 FE1 FE2 S2 FE1 S3 S3 FE4 FE3 ANGL S3 FE4 FE2 S3 FE4 FE1 S3 FE4 S4 ANGL S3 FE3 FE4 S3 FE3 FE2 S3 FE3 FE1 ANGL S3 FE3 S4 S3 FE1 FE4 S3 FE1 FE3 ANGL S3 FE1 FE2 S4 FE4 FE3 S4 FE4 FE2 ANGL S4 FE4 FE1 S4 FE3 FE4 S4 FE3 FE2 ANGL S4 FE3 FE1 S4 FE2 FE4 S4 FE2 FE3 DIHE FE1 S3 FE3 FE2 FE1 S3 FE3 FE4 DIHE FE1 S3 FE4 FE2 FE1 S3 FE4 FE3 DIHE FE1 S2 FE2 FE3 FE1 S2 FE2 FE4 DIHE FE1 S2 FE3 FE2 FE1 S2 FE3 FE4 DIHE FE1 S1 FE2 FE3 FE1 S1 FE2 FE4 DIHE FE1 S1 FE4 FE2 DIHE FE1 S1 FE4 FE3 FE1 FE4 S1 FE2 DIHE FE1 FE4 S3 FE3 FE1 FE4 S4 FE2 DIHE FE1 FE4 S4 FE3 FE1 FE4 FE2 S1 DIHE FE1 FE4 FE2 S2 FE1 FE4 FE2 S4 DIHE FE1 FE4 FE2 FE3 FE1 FE4 FE3 S2 DIHE FE1 FE4 FE3 S3 FE1 FE4 FE3 S4 DIHE FE1 FE4 FE3 FE2 FE1 FE3 S2 FE2 DIHE FE1 FE3 S3 FE4 FE1 FE3 S4 FE2 DIHE FE1 FE3 S4 FE4 FE1 FE3 FE2 S1 DIHE FE1 FE3 FE2 S2 FE1 FE3 FE2 S4 DIHE FE1 FE3 FE2 FE4 FE1 FE3 FE4 S1 DIHE FE1 FE3 FE4 S3 FE1 FE3 FE4 S4 DIHE FE1 FE3 FE4 FE2 FE1 FE2 S1 FE4 DIHE FE1 FE2 S2 FE3 FE1 FE2 S4 FE3 DIHE FE1 FE2 S4 FE4 FE1 FE2 FE3 S2 DIHE FE1 FE2 FE3 S3 FE1 FE2 FE3 S4 DIHE FE1 FE2 FE3 FE4 FE1 FE2 FE4 S1 DIHE FE1 FE2 FE4 S3 FE1 FE2 FE4 S4 DIHE FE1 FE2 FE4 FE3 FE2 S4 FE3 FE4 DIHE FE2 S4 FE4 FE3 FE2 S2 FE1 FE3 DIHE FE2 S2 FE1 FE4 FE2 S2 FE3 FE4 DIHE FE2 S1 FE1 FE3 FE2 S1 FE1 FE4 DIHE FE2 S1 FE4 FE3 FE2 FE4 S3 FE3 DIHE FE2 FE4 S4 FE3 FE2 FE4 FE1 S1 DIHE FE2 FE4 FE1 S2 FE2 FE4 FE1 S3 DIHE FE2 FE4 FE1 FE3 FE2 FE4 FE3 S2 DIHE FE2 FE4 FE3 S3 FE2 FE4 FE3 S4 DIHE FE2 FE3 S3 FE4 FE2 FE3 S4 FE4 DIHE FE2 FE3 FE1 S1 FE2 FE3 FE1 S2 DIHE FE2 FE3 FE1 S3 FE2 FE3 FE1 FE4 DIHE FE2 FE3 FE4 S1 FE2 FE3 FE4 S3 DIHE FE2 FE3 FE4 S4 FE2 FE1 S1 FE4 DIHE FE2 FE1 S2 FE3 FE2 FE1 S3 FE3 DIHE FE2 FE1 S3 FE4 FE2 FE1 FE3 S2 DIHE FE2 FE1 FE3 S3 FE2 FE1 FE3 S4 DIHE FE2 FE1 FE3 FE4 FE2 FE1 FE4 S1 DIHE FE2 FE1 FE4 S3 FE2 FE1 FE4 S4 DIHE FE2 FE1 FE4 FE3 FE3 S4 FE2 FE4 DIHE FE3 S3 FE1 FE4 FE3 S2 FE1 FE4 DIHE FE3 S2 FE2 FE4 FE3 FE4 FE1 S1 DIHE FE3 FE4 FE1 S2 FE3 FE4 FE1 S3 DIHE FE3 FE4 FE2 S1 FE3 FE4 FE2 S2 DIHE FE3 FE4 FE2 S4 FE3 FE2 S1 FE4 DIHE FE3 FE2 S4 FE4 FE3 FE2 FE1 S1 DIHE FE3 FE2 FE1 S2 FE3 FE2 FE1 S3 DIHE FE3 FE2 FE1 FE4 FE3 FE2 FE4 S1 DIHE FE3 FE2 FE4 S3 FE3 FE2 FE4 S4 DIHE FE3 FE1 S1 FE4 FE3 FE1 S3 FE4 DIHE FE3 FE1 FE2 S1 FE3 FE1 FE2 S2 DIHE FE3 FE1 FE2 S4 FE3 FE1 FE2 FE4 DIHE FE3 FE1 FE4 S1 FE3 FE1 FE4 S3 DIHE FE3 FE1 FE4 S4 FE4 FE3 FE1 S1 DIHE FE4 FE3 FE1 S2 FE4 FE3 FE1 S3 DIHE FE4 FE3 FE2 S1 FE4 FE3 FE2 S2 DIHE FE4 FE3 FE2 S4 FE4 FE2 FE1 S1 DIHE FE4 FE2 FE1 S2 FE4 FE2 FE1 S3 DIHE FE4 FE2 FE3 S2 FE4 FE2 FE3 S3 DIHE FE4 FE2 FE3 S4 FE4 FE1 FE2 S1 DIHE FE4 FE1 FE2 S2 FE4 FE1 FE2 S4 DIHE FE4 FE1 FE3 S2 FE4 FE1 FE3 S3 DIHE FE4 FE1 FE3 S4 S1 FE4 FE1 S2 DIHE S1 FE4 FE1 S3 S1 FE4 FE2 S2 DIHE S1 FE4 FE2 S4 S1 FE4 FE3 S2 DIHE S1 FE4 FE3 S3 S1 FE4 FE3 S4 DIHE S1 FE2 FE1 S2 S1 FE2 FE1 S3 DIHE S1 FE2 FE3 S2 S1 FE2 FE3 S3 DIHE S1 FE2 FE3 S4 S1 FE2 FE4 S3 DIHE S1 FE2 FE4 S4 S1 FE1 FE2 S2 DIHE S1 FE1 FE2 S4 S1 FE1 FE3 S2 DIHE S1 FE1 FE3 S3 S1 FE1 FE3 S4 DIHE S1 FE1 FE4 S3 S1 FE1 FE4 S4 DIHE S2 FE3 FE1 S3 S2 FE3 FE2 S4 DIHE S2 FE3 FE4 S3 S2 FE3 FE4 S4 DIHE S2 FE2 FE1 S3 S2 FE2 FE3 S3 DIHE S2 FE2 FE3 S4 S2 FE2 FE4 S3 DIHE S2 FE2 FE4 S4 S2 FE1 FE2 S4 DIHE S2 FE1 FE3 S3 S2 FE1 FE3 S4 DIHE S2 FE1 FE4 S3 S2 FE1 FE4 S4 DIHE S3 FE4 FE2 S4 S3 FE4 FE3 S4 DIHE S3 FE3 FE2 S4 S3 FE3 FE4 S4 DIHE S3 FE1 FE2 S4 S3 FE1 FE3 S4 DIHE S3 FE1 FE4 S4 !!! Oxidized His-ligated [4Fe4S] segment HYDD RESI FHO -0.03145 ! GROUP ATOM FE1 FEIO -0.02364 ATOM FE2 FEIO -0.02364 ATOM FE3 FEIO -0.02364 ATOM FE4 FEIO -0.02364 ATOM S1 SIO 0.01578 ATOM S2 SIO 0.01578 ATOM S3 SIO 0.01578 ATOM S4 SIO 0.01578 BOND FE1 S1 FE1 S2 FE1 S3 FE2 S1 BOND FE2 S2 FE2 S4 FE3 S2 FE3 S3 BOND FE3 S4 FE4 S1 FE4 S3 FE4 S4 BOND FE1 FE2 FE1 FE3 FE1 FE4 FE2 FE3 BOND FE2 FE4 FE3 FE4 ANGL FE1 S3 FE4 FE1 S3 FE3 S4 FE2 FE1 ANGL FE1 S2 FE3 FE1 S2 FE2 FE1 S1 FE4 ANGL FE1 S1 FE2 FE1 FE4 FE3 FE1 FE4 FE2 ANGL FE1 FE3 FE4 FE1 FE3 FE2 FE1 FE2 FE4 ANGL FE1 FE2 FE3 FE2 S4 FE4 FE2 S4 FE3 ANGL FE2 S2 FE3 FE2 S1 FE4 FE2 FE4 FE3 ANGL FE2 FE3 FE4 FE2 FE1 FE4 FE2 FE1 FE3 ANGL FE3 S4 FE4 FE3 S3 FE4 FE3 FE2 FE4 ANGL FE3 FE1 FE4 S1 FE4 FE3 S1 FE4 FE2 ANGL S1 FE4 FE1 S1 FE4 S4 S1 FE4 S3 ANGL S1 FE2 FE4 S1 FE2 FE3 S1 FE2 FE1 ANGL S1 FE2 S4 S1 FE2 S2 S1 FE1 FE4 ANGL S1 FE1 FE3 S1 FE1 FE2 S1 FE1 S3 ANGL S1 FE1 S2 S2 FE3 FE4 S2 FE3 FE2 ANGL S2 FE3 FE1 S2 FE3 S4 S2 FE3 S3 ANGL S2 FE2 FE4 S2 FE2 FE3 S2 FE2 FE1 ANGL S2 FE2 S4 S2 FE1 FE4 S2 FE1 FE3 ANGL S2 FE1 FE2 S2 FE1 S3 S3 FE4 FE3 ANGL S3 FE4 FE2 S3 FE4 FE1 S3 FE4 S4 ANGL S3 FE3 FE4 S3 FE3 FE2 S3 FE3 FE1 ANGL S3 FE3 S4 S3 FE1 FE4 S3 FE1 FE3 ANGL S3 FE1 FE2 S4 FE4 FE3 S4 FE4 FE2 ANGL S4 FE4 FE1 S4 FE3 FE4 S4 FE3 FE2 ANGL S4 FE3 FE1 S4 FE2 FE4 S4 FE2 FE3 DIHE FE1 S3 FE3 FE2 FE1 S3 FE3 FE4 DIHE FE1 S3 FE4 FE2 FE1 S3 FE4 FE3 DIHE FE1 S2 FE2 FE3 FE1 S2 FE2 FE4 DIHE FE1 S2 FE3 FE2 FE1 S2 FE3 FE4 DIHE FE1 S1 FE2 FE3 FE1 S1 FE2 FE4 DIHE FE1 S1 FE4 FE2 DIHE FE1 S1 FE4 FE3 FE1 FE4 S1 FE2 DIHE FE1 FE4 S3 FE3 FE1 FE4 S4 FE2 DIHE FE1 FE4 S4 FE3 FE1 FE4 FE2 S1 DIHE FE1 FE4 FE2 S2 FE1 FE4 FE2 S4 DIHE FE1 FE4 FE2 FE3 FE1 FE4 FE3 S2 DIHE FE1 FE4 FE3 S3 FE1 FE4 FE3 S4 DIHE FE1 FE4 FE3 FE2 FE1 FE3 S2 FE2 DIHE FE1 FE3 S3 FE4 FE1 FE3 S4 FE2 DIHE FE1 FE3 S4 FE4 FE1 FE3 FE2 S1 DIHE FE1 FE3 FE2 S2 FE1 FE3 FE2 S4 DIHE FE1 FE3 FE2 FE4 FE1 FE3 FE4 S1 DIHE FE1 FE3 FE4 S3 FE1 FE3 FE4 S4 DIHE FE1 FE3 FE4 FE2 FE1 FE2 S1 FE4 DIHE FE1 FE2 S2 FE3 FE1 FE2 S4 FE3 DIHE FE1 FE2 S4 FE4 FE1 FE2 FE3 S2 DIHE FE1 FE2 FE3 S3 FE1 FE2 FE3 S4 DIHE FE1 FE2 FE3 FE4 FE1 FE2 FE4 S1 DIHE FE1 FE2 FE4 S3 FE1 FE2 FE4 S4 DIHE FE1 FE2 FE4 FE3 FE2 S4 FE3 FE4 DIHE FE2 S4 FE4 FE3 FE2 S2 FE1 FE3 DIHE FE2 S2 FE1 FE4 FE2 S2 FE3 FE4 DIHE FE2 S1 FE1 FE3 FE2 S1 FE1 FE4 DIHE FE2 S1 FE4 FE3 FE2 FE4 S3 FE3 DIHE FE2 FE4 S4 FE3 FE2 FE4 FE1 S1 DIHE FE2 FE4 FE1 S2 FE2 FE4 FE1 S3 DIHE FE2 FE4 FE1 FE3 FE2 FE4 FE3 S2 DIHE FE2 FE4 FE3 S3 FE2 FE4 FE3 S4 DIHE FE2 FE3 S3 FE4 FE2 FE3 S4 FE4 DIHE FE2 FE3 FE1 S1 FE2 FE3 FE1 S2 DIHE FE2 FE3 FE1 S3 FE2 FE3 FE1 FE4 DIHE FE2 FE3 FE4 S1 FE2 FE3 FE4 S3 DIHE FE2 FE3 FE4 S4 FE2 FE1 S1 FE4 DIHE FE2 FE1 S2 FE3 FE2 FE1 S3 FE3 DIHE FE2 FE1 S3 FE4 FE2 FE1 FE3 S2 DIHE FE2 FE1 FE3 S3 FE2 FE1 FE3 S4 DIHE FE2 FE1 FE3 FE4 FE2 FE1 FE4 S1 DIHE FE2 FE1 FE4 S3 FE2 FE1 FE4 S4 DIHE FE2 FE1 FE4 FE3 FE3 S4 FE2 FE4 DIHE FE3 S3 FE1 FE4 FE3 S2 FE1 FE4 DIHE FE3 S2 FE2 FE4 FE3 FE4 FE1 S1 DIHE FE3 FE4 FE1 S2 FE3 FE4 FE1 S3 DIHE FE3 FE4 FE2 S1 FE3 FE4 FE2 S2 DIHE FE3 FE4 FE2 S4 FE3 FE2 S1 FE4 DIHE FE3 FE2 S4 FE4 FE3 FE2 FE1 S1 DIHE FE3 FE2 FE1 S2 FE3 FE2 FE1 S3 DIHE FE3 FE2 FE1 FE4 FE3 FE2 FE4 S1 DIHE FE3 FE2 FE4 S3 FE3 FE2 FE4 S4 DIHE FE3 FE1 S1 FE4 FE3 FE1 S3 FE4 DIHE FE3 FE1 FE2 S1 FE3 FE1 FE2 S2 DIHE FE3 FE1 FE2 S4 FE3 FE1 FE2 FE4 DIHE FE3 FE1 FE4 S1 FE3 FE1 FE4 S3 DIHE FE3 FE1 FE4 S4 FE4 FE3 FE1 S1 DIHE FE4 FE3 FE1 S2 FE4 FE3 FE1 S3 DIHE FE4 FE3 FE2 S1 FE4 FE3 FE2 S2 DIHE FE4 FE3 FE2 S4 FE4 FE2 FE1 S1 DIHE FE4 FE2 FE1 S2 FE4 FE2 FE1 S3 DIHE FE4 FE2 FE3 S2 FE4 FE2 FE3 S3 DIHE FE4 FE2 FE3 S4 FE4 FE1 FE2 S1 DIHE FE4 FE1 FE2 S2 FE4 FE1 FE2 S4 DIHE FE4 FE1 FE3 S2 FE4 FE1 FE3 S3 DIHE FE4 FE1 FE3 S4 S1 FE4 FE1 S2 DIHE S1 FE4 FE1 S3 S1 FE4 FE2 S2 DIHE S1 FE4 FE2 S4 S1 FE4 FE3 S2 DIHE S1 FE4 FE3 S3 S1 FE4 FE3 S4 DIHE S1 FE2 FE1 S2 S1 FE2 FE1 S3 DIHE S1 FE2 FE3 S2 S1 FE2 FE3 S3 DIHE S1 FE2 FE3 S4 S1 FE2 FE4 S3 DIHE S1 FE2 FE4 S4 S1 FE1 FE2 S2 DIHE S1 FE1 FE2 S4 S1 FE1 FE3 S2 DIHE S1 FE1 FE3 S3 S1 FE1 FE3 S4 DIHE S1 FE1 FE4 S3 S1 FE1 FE4 S4 DIHE S2 FE3 FE1 S3 S2 FE3 FE2 S4 DIHE S2 FE3 FE4 S3 S2 FE3 FE4 S4 DIHE S2 FE2 FE1 S3 S2 FE2 FE3 S3 DIHE S2 FE2 FE3 S4 S2 FE2 FE4 S3 DIHE S2 FE2 FE4 S4 S2 FE1 FE2 S4 DIHE S2 FE1 FE3 S3 S2 FE1 FE3 S4 DIHE S2 FE1 FE4 S3 S2 FE1 FE4 S4 DIHE S3 FE4 FE2 S4 S3 FE4 FE3 S4 DIHE S3 FE3 FE2 S4 S3 FE3 FE4 S4 DIHE S3 FE1 FE2 S4 S3 FE1 FE3 S4 DIHE S3 FE1 FE4 S4 !!! Reduced His-ligated [4Fe4S] segment HYDD RESI FHR -0.23760 ! GROUP ATOM FE1 FEIR 0.80816 ATOM FE2 FEIR 0.80816 ATOM FE3 FEIR 0.80816 ATOM FE4 FEIR 0.80816 ATOM S1 SIR -0.86756 ATOM S2 SIR -0.86756 ATOM S3 SIR -0.86756 ATOM S4 SIR -0.86756 BOND FE1 S1 FE1 S2 FE1 S3 FE2 S1 BOND FE2 S2 FE2 S4 FE3 S2 FE3 S3 BOND FE3 S4 FE4 S1 FE4 S3 FE4 S4 BOND FE1 FE2 FE1 FE3 FE1 FE4 FE2 FE3 BOND FE2 FE4 FE3 FE4 ANGL FE1 S3 FE4 FE1 S3 FE3 S4 FE2 FE1 ANGL FE1 S2 FE3 FE1 S2 FE2 FE1 S1 FE4 ANGL FE1 S1 FE2 FE1 FE4 FE3 FE1 FE4 FE2 ANGL FE1 FE3 FE4 FE1 FE3 FE2 FE1 FE2 FE4 ANGL FE1 FE2 FE3 FE2 S4 FE4 FE2 S4 FE3 ANGL FE2 S2 FE3 FE2 S1 FE4 FE2 FE4 FE3 ANGL FE2 FE3 FE4 FE2 FE1 FE4 FE2 FE1 FE3 ANGL FE3 S4 FE4 FE3 S3 FE4 FE3 FE2 FE4 ANGL FE3 FE1 FE4 S1 FE4 FE3 S1 FE4 FE2 ANGL S1 FE4 FE1 S1 FE4 S4 S1 FE4 S3 ANGL S1 FE2 FE4 S1 FE2 FE3 S1 FE2 FE1 ANGL S1 FE2 S4 S1 FE2 S2 S1 FE1 FE4 ANGL S1 FE1 FE3 S1 FE1 FE2 S1 FE1 S3 ANGL S1 FE1 S2 S2 FE3 FE4 S2 FE3 FE2 ANGL S2 FE3 FE1 S2 FE3 S4 S2 FE3 S3 ANGL S2 FE2 FE4 S2 FE2 FE3 S2 FE2 FE1 ANGL S2 FE2 S4 S2 FE1 FE4 S2 FE1 FE3 ANGL S2 FE1 FE2 S2 FE1 S3 S3 FE4 FE3 ANGL S3 FE4 FE2 S3 FE4 FE1 S3 FE4 S4 ANGL S3 FE3 FE4 S3 FE3 FE2 S3 FE3 FE1 ANGL S3 FE3 S4 S3 FE1 FE4 S3 FE1 FE3 ANGL S3 FE1 FE2 S4 FE4 FE3 S4 FE4 FE2 ANGL S4 FE4 FE1 S4 FE3 FE4 S4 FE3 FE2 ANGL S4 FE3 FE1 S4 FE2 FE4 S4 FE2 FE3 DIHE FE1 S3 FE3 FE2 FE1 S3 FE3 FE4 DIHE FE1 S3 FE4 FE2 FE1 S3 FE4 FE3 DIHE FE1 S2 FE2 FE3 FE1 S2 FE2 FE4 DIHE FE1 S2 FE3 FE2 FE1 S2 FE3 FE4 DIHE FE1 S1 FE2 FE3 FE1 S1 FE2 FE4 DIHE FE1 S1 FE4 FE2 DIHE FE1 S1 FE4 FE3 FE1 FE4 S1 FE2 DIHE FE1 FE4 S3 FE3 FE1 FE4 S4 FE2 DIHE FE1 FE4 S4 FE3 FE1 FE4 FE2 S1 DIHE FE1 FE4 FE2 S2 FE1 FE4 FE2 S4 DIHE FE1 FE4 FE2 FE3 FE1 FE4 FE3 S2 DIHE FE1 FE4 FE3 S3 FE1 FE4 FE3 S4 DIHE FE1 FE4 FE3 FE2 FE1 FE3 S2 FE2 DIHE FE1 FE3 S3 FE4 FE1 FE3 S4 FE2 DIHE FE1 FE3 S4 FE4 FE1 FE3 FE2 S1 DIHE FE1 FE3 FE2 S2 FE1 FE3 FE2 S4 DIHE FE1 FE3 FE2 FE4 FE1 FE3 FE4 S1 DIHE FE1 FE3 FE4 S3 FE1 FE3 FE4 S4 DIHE FE1 FE3 FE4 FE2 FE1 FE2 S1 FE4 DIHE FE1 FE2 S2 FE3 FE1 FE2 S4 FE3 DIHE FE1 FE2 S4 FE4 FE1 FE2 FE3 S2 DIHE FE1 FE2 FE3 S3 FE1 FE2 FE3 S4 DIHE FE1 FE2 FE3 FE4 FE1 FE2 FE4 S1 DIHE FE1 FE2 FE4 S3 FE1 FE2 FE4 S4 DIHE FE1 FE2 FE4 FE3 FE2 S4 FE3 FE4 DIHE FE2 S4 FE4 FE3 FE2 S2 FE1 FE3 DIHE FE2 S2 FE1 FE4 FE2 S2 FE3 FE4 DIHE FE2 S1 FE1 FE3 FE2 S1 FE1 FE4 DIHE FE2 S1 FE4 FE3 FE2 FE4 S3 FE3 DIHE FE2 FE4 S4 FE3 FE2 FE4 FE1 S1 DIHE FE2 FE4 FE1 S2 FE2 FE4 FE1 S3 DIHE FE2 FE4 FE1 FE3 FE2 FE4 FE3 S2 DIHE FE2 FE4 FE3 S3 FE2 FE4 FE3 S4 DIHE FE2 FE3 S3 FE4 FE2 FE3 S4 FE4 DIHE FE2 FE3 FE1 S1 FE2 FE3 FE1 S2 DIHE FE2 FE3 FE1 S3 FE2 FE3 FE1 FE4 DIHE FE2 FE3 FE4 S1 FE2 FE3 FE4 S3 DIHE FE2 FE3 FE4 S4 FE2 FE1 S1 FE4 DIHE FE2 FE1 S2 FE3 FE2 FE1 S3 FE3 DIHE FE2 FE1 S3 FE4 FE2 FE1 FE3 S2 DIHE FE2 FE1 FE3 S3 FE2 FE1 FE3 S4 DIHE FE2 FE1 FE3 FE4 FE2 FE1 FE4 S1 DIHE FE2 FE1 FE4 S3 FE2 FE1 FE4 S4 DIHE FE2 FE1 FE4 FE3 FE3 S4 FE2 FE4 DIHE FE3 S3 FE1 FE4 FE3 S2 FE1 FE4 DIHE FE3 S2 FE2 FE4 FE3 FE4 FE1 S1 DIHE FE3 FE4 FE1 S2 FE3 FE4 FE1 S3 DIHE FE3 FE4 FE2 S1 FE3 FE4 FE2 S2 DIHE FE3 FE4 FE2 S4 FE3 FE2 S1 FE4 DIHE FE3 FE2 S4 FE4 FE3 FE2 FE1 S1 DIHE FE3 FE2 FE1 S2 FE3 FE2 FE1 S3 DIHE FE3 FE2 FE1 FE4 FE3 FE2 FE4 S1 DIHE FE3 FE2 FE4 S3 FE3 FE2 FE4 S4 DIHE FE3 FE1 S1 FE4 FE3 FE1 S3 FE4 DIHE FE3 FE1 FE2 S1 FE3 FE1 FE2 S2 DIHE FE3 FE1 FE2 S4 FE3 FE1 FE2 FE4 DIHE FE3 FE1 FE4 S1 FE3 FE1 FE4 S3 DIHE FE3 FE1 FE4 S4 FE4 S4 FE2 S1 DIHE FE4 FE3 FE1 S1 DIHE FE4 FE3 FE1 S2 FE4 FE3 FE1 S3 DIHE FE4 FE3 FE2 S1 FE4 FE3 FE2 S2 DIHE FE4 FE3 FE2 S4 FE4 FE2 FE1 S1 DIHE FE4 FE2 FE1 S2 FE4 FE2 FE1 S3 DIHE FE4 FE2 FE3 S2 FE4 FE2 FE3 S3 DIHE FE4 FE2 FE3 S4 FE4 FE1 FE2 S1 DIHE FE4 FE1 FE2 S2 FE4 FE1 FE2 S4 DIHE FE4 FE1 FE3 S2 FE4 FE1 FE3 S3 DIHE FE4 FE1 FE3 S4 S1 FE4 FE1 S2 DIHE S1 FE4 FE1 S3 S1 FE4 FE2 S2 DIHE S1 FE4 FE2 S4 S1 FE4 FE3 S2 DIHE S1 FE4 FE3 S3 S1 FE4 FE3 S4 DIHE S1 FE2 FE1 S2 S1 FE2 FE1 S3 DIHE S1 FE2 FE3 S2 S1 FE2 FE3 S3 DIHE S1 FE2 FE3 S4 S1 FE2 FE4 S3 DIHE S1 FE2 FE4 S4 S1 FE1 FE2 S2 DIHE S1 FE1 FE2 S4 S1 FE1 FE3 S2 DIHE S1 FE1 FE3 S3 S1 FE1 FE3 S4 DIHE S1 FE1 FE4 S3 S1 FE1 FE4 S4 DIHE S2 FE3 FE1 S3 S2 FE3 FE2 S4 DIHE S2 FE3 FE4 S3 S2 FE3 FE4 S4 DIHE S2 FE2 FE1 S3 S2 FE2 FE3 S3 DIHE S2 FE2 FE3 S4 S2 FE2 FE4 S3 DIHE S2 FE2 FE4 S4 S2 FE1 FE2 S4 DIHE S2 FE1 FE3 S3 S2 FE1 FE3 S4 DIHE S2 FE1 FE4 S3 S2 FE1 FE4 S4 DIHE S3 FE4 FE2 S4 S3 FE4 FE3 S4 DIHE S3 FE3 FE2 S4 S3 FE3 FE4 S4 DIHE S3 FE1 FE2 S4 S3 FE1 FE3 S4 DIHE S3 FE1 FE4 S4 !!! Reduced "Fe(I)-Fe(II)" H-cluster segment HYDH RESI HCR -1.00! ATOM FE1 FEL1 -0.19373 ATOM FE2 FEL2 -0.29303 ATOM S1 SL1 0.01831 ATOM S2 SL2 0.00690 ATOM O3 OL4 -0.37185 ATOM N4 NL5 -0.39702 ATOM O5 OL6 -0.34865 ATOM N6 NL5 -0.38678 ATOM O7 OL4 -0.35972 ATOM C3 CLO1 0.42940 ATOM C4 CLN1 0.02753 ATOM C5 CLC 0.39227 ATOM C6 CLN2 0.07199 ATOM C7 CLO2 0.46579 ATOM N1 NLM -0.50106 ATOM HN H 0.30269 ATOM CB1 CCL1 -0.29430 ATOM HB1 HCL1 0.17601 ATOM HB2 HCL2 0.18442 ATOM CB3 CCL1 -0.29101 ATOM HB3 HCL2 0.18684 ATOM HB4 HCL1 0.16972 ATOM HH1 HH 0.00528 BOND FE1 S1 FE1 S2 FE1 C3 FE1 C4 BOND FE2 C6 FE1 C5 FE2 S1 FE2 S2 BOND FE2 C5 FE2 C7 S1 CB1 S2 CB3 BOND CB1 HB1 CB1 HB2 CB3 HB3 CB3 HB4 BOND N1 HN N1 CB1 N1 CB3 HH1 FE2 TRIPLE O3 C3 N4 C4 O5 C5 N6 C6 TRIPLE O7 C7 ANGL FE1 C5 O5 FE1 C5 FE2 FE1 C4 N4 ANGL FE1 C3 O3 FE1 S2 CB3 FE1 S2 FE2 ANGL FE1 S1 CB1 FE1 S1 FE2 FE2 C7 O7 ANGL FE2 C6 N6 FE2 C5 O5 FE2 S2 CB3 ANGL FE2 S1 CB1 S1 CB1 N1 S1 CB1 HB2 ANGL S1 CB1 HB1 S1 FE2 HH1 S1 FE2 C7 ANGL S1 FE2 C5 S1 FE2 S2 S1 FE1 C5 ANGL S1 FE1 C4 S1 FE1 C3 S1 FE1 S2 ANGL S2 CB3 N1 S2 CB3 HB4 S2 CB3 HB3 ANGL S2 FE2 HH1 S2 FE2 C7 S2 FE2 C5 ANGL S2 FE1 C5 S2 FE1 C4 S2 FE1 C3 ANGL C3 FE1 C5 C3 FE1 C4 C4 FE1 C5 ANGL C5 FE2 HH1 C5 FE2 C7 C6 FE2 HH1 ANGL C6 FE2 C7 C6 FE2 C5 C6 FE2 S2 ANGL C6 FE2 S1 C7 FE2 HH1 HN N1 CB3 ANGL HN N1 CB1 CB1 N1 CB3 HB1 CB1 N1 ANGL HB1 CB1 HB2 HB2 CB1 N1 HB3 CB3 N1 ANGL HB3 CB3 HB4 HB4 CB3 N1 DIHE FE1 C5 FE2 C6 FE1 C5 FE2 S1 DIHE FE1 C5 FE2 S2 FE1 C5 FE2 C7 DIHE FE1 S2 FE2 C6 FE1 S1 CB1 N1 DIHE FE1 S2 FE2 S1 FE1 S2 FE2 C5 DIHE FE1 S2 FE2 HH1 FE1 S2 CB3 HB3 DIHE FE1 S2 CB3 HB4 FE1 S2 CB3 N1 DIHE FE1 S1 FE2 S2 FE1 S1 FE2 C5 DIHE FE1 S1 FE2 C7 FE1 S1 FE2 HH1 DIHE FE1 S1 CB1 HB1 FE1 S1 CB1 HB2 DIHE FE2 C5 FE1 S1 FE2 S1 CB1 N1 DIHE FE2 C5 FE1 S2 FE2 C5 FE1 C3 DIHE FE2 C5 FE1 C4 FE2 S2 FE1 S1 DIHE FE2 S2 FE1 C3 FE2 S2 FE1 C5 DIHE FE2 S2 CB3 HB3 FE2 S2 CB3 HB4 DIHE FE2 S2 CB3 N1 FE2 S1 FE1 S2 DIHE FE2 S1 FE1 C4 FE2 S1 FE1 C5 DIHE FE2 S1 CB1 HB1 FE2 S1 CB1 HB2 DIHE S1 CB1 N1 HN DIHE S1 CB1 N1 CB3 S1 FE2 S2 CB3 DIHE S1 FE1 S2 CB3 S1 FE1 C5 O5 DIHE S2 CB3 N1 HN S2 CB3 N1 CB1 DIHE S2 FE2 S1 CB1 S2 FE2 C5 O5 DIHE S2 FE1 S1 CB1 S2 FE1 C5 O5 DIHE O5 C5 FE1 C3 O5 C5 FE1 C4 DIHE O5 C5 FE2 C6 O5 C5 FE2 C7 DIHE C3 FE1 S2 CB3 DIHE C4 FE1 S1 CB1 C5 FE2 S1 CB1 DIHE C5 FE2 S2 CB3 C5 FE1 S1 CB1 DIHE C5 FE1 S2 CB3 C6 FE2 S2 CB3 DIHE C7 FE2 S1 CB1 HN N1 CB1 HB1 DIHE HN N1 CB1 HB2 HN N1 CB3 HB3 DIHE HN N1 CB3 HB4 CB1 N1 CB3 HB3 DIHE CB1 N1 CB3 HB4 CB1 S1 FE2 HH1 DIHE HB1 CB1 N1 CB3 HB2 CB1 N1 CB3 DIHE CB3 S2 FE2 HH1 IMPR N6 C6 C7 FE2 O7 C7 C6 FE2 IC FE1 S2 S1 CB1 2.3357 47.0408 -134.4427 78.4580 1.9133 IC FE1 S1 S2 CB3 2.3472 46.7387 134.9792 79.0947 1.9128 IC FE1 S1 CB1 N1 2.3472 111.2520 -63.5219 118.7196 1.4507 IC FE1 S2 CB3 N1 2.3357 112.2737 62.4126 118.3568 1.4499 IC FE1 S1 CB1 HB1 2.3472 111.2520 60.0899 106.2605 1.1027 IC FE1 S1 CB1 HB2 2.3472 111.2520 175.1306 104.3815 1.1008 IC FE2 S2 CB3 HB3 2.3654 106.6331 110.8096 104.2490 1.1033 IC FE2 S2 CB3 HB4 2.3654 106.6331 -133.9197 107.0784 1.1009 IC S1 CB1 N1 CB3 1.9133 118.7196 63.8897 115.6870 1.4499 IC CB1 N1 CB3 S2 1.4507 115.6870 -62.7725 118.3568 1.9128 IC FE2 S2 CB3 N1 2.3654 106.6331 -10.1018 118.3568 1.4499 IC FE2 S1 CB1 N1 2.3471 106.7300 8.9572 118.7196 1.4507 IC C3 FE1 S2 CB3 1.7707 92.9550 140.9576 112.2737 1.9128 IC C4 FE1 S1 CB1 1.9451 87.6807 -141.4511 111.2520 1.9133 IC C5 FE1 S1 CB1 2.4309 87.1607 131.3410 111.2520 1.9133 IC C5 FE2 S2 CB3 1.8481 95.7725 159.2111 106.6331 1.9128 IC C6 FE2 S2 CB3 1.9426 89.4235 -113.0929 106.6331 1.9128 IC C7 FE2 S1 CB1 1.7747 90.3921 116.8097 106.7300 1.9133 IC O3 C3 C4 FE1 1.1789 132.0441 -175.9035 41.6903 1.9451 IC N4 C4 S1 FE1 1.1868 129.2845 -174.4134 40.5872 2.3472 IC O5 C5 FE2 C7 1.1754 159.3296 -46.8095 92.1346 1.7747 IC N6 C6 C7 FE2 1.1846 138.0507 177.2080 45.8119 1.7747 IC O7 C7 C6 FE2 1.1727 133.5612 -176.3078 40.9258 1.9426 IC HN N1 CB1 HB1 1.0303 109.0007 178.8884 109.3598 1.1027 IC HN N1 CB1 HB2 1.0303 109.0007 60.0317 108.8192 1.1008 IC HN N1 CB3 HB3 1.0303 108.7905 -58.3132 108.7390 1.1033 IC HN N1 CB3 HB4 1.0303 108.7905 -176.9642 109.1892 1.1009 IC HH1 FE2 S1 CB1 1.5356 92.7493 35.8691 106.7300 1.9133 !!! Oxidized "Fe(I)-Fe(II)" H-cluster segment HYDH RESI HCO -1.00 ATOM FE1 FEM1 -0.22930 ATOM FE2 FEM2 0.00276 ATOM S1 SM1 -0.03055 ATOM S2 SM2 -0.04107 ATOM O3 OM4 -0.38084 ATOM N4 NM5 -0.40514 ATOM O5 OM6 -0.37296 ATOM N6 NM5 -0.37139 ATOM O7 OM4 -0.36663 ATOM C3 CMO1 0.44093 ATOM C4 CMN1 0.03875 ATOM C5 CMC 0.34359 ATOM C6 CMN2 -0.00642 ATOM C7 CMO2 0.43330 ATOM N1 NMM -0.51356 ATOM HN H 0.31571 ATOM CB1 CCM1 -0.30040 ATOM HB1 HCM1 0.17586 ATOM HB2 HCM2 0.18896 ATOM CB3 CCM1 -0.28745 ATOM HB3 HCM2 0.19453 ATOM HB4 HCM1 0.17132 BOND FE1 S1 FE1 S2 FE1 C3 FE1 C4 BOND FE2 C6 FE1 C5 FE2 S1 FE2 S2 BOND FE2 C5 FE2 C7 S1 CB1 S2 CB3 BOND CB1 HB1 CB1 HB2 CB3 HB3 CB3 HB4 BOND N1 HN N1 CB1 N1 CB3 TRIPLE O3 C3 N4 C4 O5 C5 N6 C6 TRIPLE O7 C7 ANGL FE1 C5 O5 FE1 C5 FE2 FE1 C4 N4 ANGL FE1 C3 O3 FE1 S2 CB3 FE1 S2 FE2 ANGL FE1 S1 CB1 FE1 S1 FE2 FE2 C7 O7 ANGL FE2 C6 N6 FE2 C5 O5 FE2 S2 CB3 ANGL FE2 S1 CB1 S1 CB1 N1 S1 CB1 HB2 ANGL S1 CB1 HB1 S1 FE2 C7 C5 FE2 C7 ANGL S1 FE2 C5 S1 FE2 S2 S1 FE1 C5 ANGL S1 FE1 C4 S1 FE1 C3 S1 FE1 S2 ANGL S2 CB3 N1 S2 CB3 HB4 S2 CB3 HB3 ANGL S2 FE1 C5 S2 FE1 C4 S2 FE1 C3 ANGL C3 FE1 C5 C3 FE1 C4 C4 FE1 C5 ANGL C6 FE2 C7 C6 FE2 C5 C6 FE2 S2 ANGL HN N1 CB1 CB1 N1 CB3 HB1 CB1 N1 ANGL HB1 CB1 HB2 HB2 CB1 N1 HB3 CB3 N1 ANGL HB3 CB3 HB4 HB4 CB3 N1 S2 FE2 C7 ANGL C6 FE2 S1 HN N1 CB3 S2 FE2 C5 DIHE FE1 C5 FE2 C6 FE1 C5 FE2 S1 DIHE FE1 C5 FE2 S2 FE1 C5 FE2 C7 DIHE FE1 S2 FE2 C6 FE1 S2 FE2 S1 DIHE FE1 S2 FE2 C5 FE1 S2 CB3 N1 DIHE FE1 S1 FE2 S2 FE1 S2 CB3 HB3 DIHE FE1 S2 CB3 HB4 FE1 S1 FE2 C5 DIHE FE1 S1 FE2 C7 FE1 S1 CB1 N1 DIHE FE1 S1 CB1 HB1 FE1 S1 CB1 HB2 DIHE FE2 C5 FE1 S1 FE2 C5 FE1 S2 DIHE FE2 C5 FE1 C3 FE2 C5 FE1 C4 DIHE FE2 S2 FE1 S1 FE2 S1 FE1 S2 DIHE FE2 S2 FE1 C3 FE2 S2 FE1 C5 DIHE FE2 S2 CB3 N1 FE2 S2 CB3 HB3 DIHE FE2 S2 CB3 HB4 FE2 S1 FE1 C4 DIHE FE2 S1 FE1 C5 FE2 S1 CB1 N1 DIHE FE2 S1 CB1 HB1 FE2 S1 CB1 HB2 DIHE S1 CB1 N1 HN S1 CB1 N1 CB3 DIHE S1 FE1 S2 CB3 S1 FE2 S2 CB3 DIHE S1 FE2 C5 O5 S1 FE1 C5 O5 DIHE S2 CB3 N1 HN S2 CB3 N1 CB1 DIHE S2 FE1 S1 CB1 S2 FE2 S1 CB1 DIHE S2 FE2 C5 O5 S2 FE1 C5 O5 DIHE O5 C5 FE1 C3 O5 C5 FE1 C4 DIHE O5 C5 FE2 C6 O5 C5 FE2 C7 DIHE C3 FE1 S2 CB3 C4 FE1 S1 CB1 DIHE C5 FE2 S1 CB1 C5 FE2 S2 CB3 DIHE C5 FE1 S1 CB1 C5 FE1 S2 CB3 DIHE HN N1 CB1 HB1 C6 FE2 S2 CB3 DIHE C7 FE2 S1 CB1 HN N1 CB1 HB2 DIHE HN N1 CB3 HB3 HN N1 CB3 HB4 DIHE CB1 N1 CB3 HB3 CB1 N1 CB3 HB4 DIHE HB1 CB1 N1 CB3 HB2 CB1 N1 CB3 IMPR O5 FE1 FE2 C5 IMPR FE1 C5 C3 O3 IMPR FE2 S1 C7 O7 IMPR FE1 S1 C4 N4 IMPR FE2 S2 C6 N6 IC FE1 S2 S1 CB1 2.3706 46.9956 -134.8451 76.7010 1.9136 IC FE1 S1 S2 CB3 2.3993 46.2650 138.0604 78.6792 1.9207 IC C3 FE1 S2 CB3 1.7696 92.2942 138.4947 113.5473 1.9207 IC C4 FE1 S1 CB1 1.9405 87.9642 -142.6066 109.6845 1.9136 IC C5 FE1 S1 CB1 2.1765 91.7532 128.2425 109.6845 1.9136 IC C5 FE2 S2 CB3 1.8629 88.8773 158.7212 105.1580 1.9207 IC C6 FE2 S2 CB3 1.9374 92.2621 -64.9720 105.1580 1.9207 IC C7 FE2 S1 CB1 1.7784 92.1545 128.2523 105.1721 1.9136 IC FE1 S1 CB1 N1 2.3993 109.6845 -65.7480 118.6109 1.4512 IC FE1 S2 CB3 N1 2.3706 113.5473 58.2997 118.1504 1.4452 IC FE1 S1 CB1 HB1 2.3993 109.6845 58.5165 107.4602 1.1029 IC FE1 S1 CB1 HB2 2.3993 109.6845 173.5586 103.6952 1.1011 IC FE2 S2 CB3 HB3 2.3421 105.1580 108.8840 104.0996 1.1001 IC FE2 S2 CB3 HB4 2.3421 105.1580 -135.7329 106.5839 1.1033 IC S1 CB1 N1 CB3 1.9136 118.6109 68.3978 116.3229 1.4452 IC CB1 N1 CB3 S2 1.4512 116.3229 -62.6768 118.1504 1.9207 IC FE2 S2 CB3 N1 2.3421 105.1580 -12.0836 118.1504 1.4452 IC FE2 S1 CB1 N1 2.3632 105.1721 3.2384 118.6109 1.4512 IC O3 C3 C4 FE1 1.1791 133.1279 -175.9459 41.3256 1.9405 IC N4 C4 S1 FE1 1.1869 128.9673 -174.3635 39.7666 2.3993 IC O5 C5 FE2 C7 1.1885 147.6809 -52.2098 89.6129 1.7784 IC N6 C6 C7 FE2 1.1875 138.5104 173.5161 48.1196 1.7784 IC O7 C7 C6 FE2 1.1754 130.9892 -179.6396 43.1116 1.9374 IC HN N1 CB1 HB1 1.0288 110.8770 178.5940 109.1362 1.1029 IC HN N1 CB1 HB2 1.0288 110.8770 60.0911 108.7841 1.1011 IC HN N1 CB3 HB3 1.0288 109.7881 -54.1994 108.9710 1.1001 IC HN N1 CB3 HB4 1.0288 109.7881 -173.5794 109.4865 1.1033 !!! Patches to ligate clusters and modify cysteinate charges to reflect ligation. PRES F2-1O -0.50701 ! patch for CYS to FE1 of oxidized [2Fe2S] (1-F2O 2-CYS) ! ATOM 2N NH1 -0.47 ATOM 2HN H 0.31 ATOM 2CA CT1 0.07 ATOM 2HA HB 0.09 ATOM 2CB CT2 -0.81869 ATOM 2HB1 HA 0.33818 ATOM 2HB2 HA 0.33818 ATOM 2SG S -0.36468 DELETE ATOM 2HG1 BOND 1FE1 2SG ANGL 2SG 1FE1 1S1 2SG 1FE1 1S2 ANGL 1FE1 2SG 2CB DIHE 1FE1 2SG 2CB 2HB1 1FE1 2SG 2CB 2HB2 DIHE 2CB 2SG 1FE1 1S1 2CB 2SG 1FE1 1S2 DIHE 2SG 1FE1 1S1 1FE2 2SG 1FE1 1S2 1FE2 PRES F2-2O -0.50701 ! patch for CYS to FE2 of oxidized [2Fe2S] (1-F2O 2-CYS) ! ATOM 2N NH1 -0.47 ATOM 2HN H 0.31 ATOM 2CA CT1 0.07 ATOM 2HA HB 0.09 ATOM 2CB CT2 -0.81869 ATOM 2HB1 HA 0.33818 ATOM 2HB2 HA 0.33818 ATOM 2SG S -0.36468 DELETE ATOM 2HG1 BOND 1FE2 2SG ANGL 2SG 1FE2 1S1 2SG 1FE2 1S2 ANGL 1FE2 2SG 2CB DIHE 1FE2 2SG 2CB 2HB1 1FE2 2SG 2CB 2HB2 DIHE 2CB 2SG 1FE2 1S1 2CB 2SG 1FE2 1S2 DIHE 2SG 1FE2 1S1 1FE1 2SG 1FE2 1S2 1FE1 PRES F2-1R -0.56228 ! patch for CYS to FE1 of reduced [2Fe2S] (1-F2R 2-CYS) ! ATOM 2N NH1 -0.47 ATOM 2HN H 0.31 ATOM 2CA CT1 0.07 ATOM 2HA HB 0.09 ATOM 2CB CT2 -0.84492 ATOM 2HB1 HA 0.33094 ATOM 2HB2 HA 0.33094 ATOM 2SG S -0.37924 DELETE ATOM 2HG1 BOND 1FE1 2SG ANGL 2SG 1FE1 1S1 2SG 1FE1 1S2 ANGL 1FE1 2SG 2CB DIHE 1FE1 2SG 2CB 2HB1 1FE1 2SG 2CB 2HB2 DIHE 2CB 2SG 1FE1 1S1 2CB 2SG 1FE1 1S2 DIHE 2SG 1FE1 1S1 1FE2 2SG 1FE1 1S2 1FE2 PRES F2-2R -0.56228 ! patch for CYS to FE2 of reduced [2Fe2S] (1-F2R 2-CYS) ! ATOM 2N NH1 -0.47 ATOM 2HN H 0.31 ATOM 2CA CT1 0.07 ATOM 2HA HB 0.09 ATOM 2CB CT2 -0.84492 ATOM 2HB1 HA 0.33094 ATOM 2HB2 HA 0.33094 ATOM 2SG S -0.37924 DELETE ATOM 2HG1 BOND 1FE2 2SG ANGL 2SG 1FE2 1S1 2SG 1FE2 1S2 ANGL 1FE2 2SG 2CB DIHE 1FE2 2SG 2CB 2HB1 1FE2 2SG 2CB 2HB2 DIHE 2CB 2SG 1FE2 1S1 2CB 2SG 1FE2 1S2 DIHE 2SG 1FE2 1S1 1FE1 2SG 1FE2 1S2 1FE1 PRES F4-1O -0.635126 ! patch for CYS to FE1 of oxidized [4Fe4S] (1-F4O 2-CYS). ATOM 2N NH1 -0.47 ATOM 2HN H 0.31 ATOM 2CA CT1 0.07 ATOM 2HA HB 0.09 ATOM 2CB CT2 -0.82229 ATOM 2HB1 HA 0.342857 ATOM 2HB2 HA 0.342857 ATOM 2SG S -0.49855 DELETE ATOM 2HG1 BOND 1FE1 2SG ANGL 1FE2 1FE1 2SG ANGL 1FE3 1FE1 2SG ANGL 1FE4 1FE1 2SG ANGL 1S1 1FE1 2SG ANGL 1S2 1FE1 2SG ANGL 1S3 1FE1 2SG ANGL 1FE1 2SG 2CB DIHE 1FE1 2SG 2CB 2HB1 DIHE 1FE1 2SG 2CB 2HB2 DIHE 1FE2 1FE1 2SG 2CB DIHE 1FE2 1FE3 1FE1 2SG DIHE 1FE2 1FE4 1FE1 2SG DIHE 1FE2 1S1 1FE1 2SG DIHE 1FE2 1S2 1FE1 2SG DIHE 1FE3 1FE1 2SG 2CB DIHE 1FE3 1FE2 1FE1 2SG DIHE 1FE3 1FE4 1FE1 2SG DIHE 1FE3 1S2 1FE1 2SG DIHE 1FE3 1S3 1FE1 2SG DIHE 1FE4 1FE1 2SG 2CB DIHE 1FE4 1FE2 1FE1 2SG DIHE 1FE4 1FE3 1FE1 2SG DIHE 1FE4 1S1 1FE1 2SG DIHE 1FE4 1S3 1FE1 2SG DIHE 1S1 1FE2 1FE1 2SG DIHE 1S1 1FE4 1FE1 2SG DIHE 1S1 1FE1 2SG 2CB DIHE 1S2 1FE2 1FE1 2SG DIHE 1S2 1FE3 1FE1 2SG DIHE 1S2 1FE1 2SG 2CB DIHE 1S3 1FE3 1FE1 2SG DIHE 1S3 1FE4 1FE1 2SG DIHE 1S3 1FE1 2SG 2CB DIHE 1S4 1FE2 1FE1 2SG DIHE 1S4 1FE3 1FE1 2SG DIHE 1S4 1FE4 1FE1 2SG PRES F4-2O -0.635126 ! patch for CYS to FE2 of oxidized [4Fe4S] (1-F4O 2-CYS). ATOM 2N NH1 -0.47 ATOM 2HN H 0.31 ATOM 2CA CT1 0.07 ATOM 2HA HB 0.09 ATOM 2CB CT2 -0.82229 ATOM 2HB1 HA 0.342857 ATOM 2HB2 HA 0.342857 ATOM 2SG S -0.49855 DELETE ATOM 2HG1 BOND 1FE2 2SG ANGL 1FE1 1FE2 2SG ANGL 1FE3 1FE2 2SG ANGL 1FE4 1FE2 2SG ANGL 1S1 1FE2 2SG ANGL 1S2 1FE2 2SG ANGL 1S4 1FE2 2SG ANGL 1FE2 2SG 2CB DIHE 1FE1 1FE2 2SG 2CB DIHE 1FE1 1FE3 1FE2 2SG DIHE 1FE1 1FE4 1FE2 2SG DIHE 1FE1 1S1 1FE2 2SG DIHE 1FE1 1S2 1FE2 2SG DIHE 1FE2 2SG 2CB 2HB1 DIHE 1FE2 2SG 2CB 2HB2 DIHE 1FE3 1FE1 1FE2 2SG DIHE 1FE3 1FE2 2SG 2CB DIHE 1FE3 1FE4 1FE2 2SG DIHE 1FE3 1S2 1FE2 2SG DIHE 1FE3 1S4 1FE2 2SG DIHE 1FE4 1FE1 1FE2 2SG DIHE 1FE4 1FE2 2SG 2CB DIHE 1FE4 1FE3 1FE2 2SG DIHE 1FE4 1S1 1FE2 2SG DIHE 1FE4 1S4 1FE2 2SG DIHE 1S1 1FE4 1FE2 2SG DIHE 1S1 1FE1 1FE2 2SG DIHE 1S1 1FE2 2SG 2CB DIHE 1S2 1FE2 2SG 2CB DIHE 1S2 1FE3 1FE2 2SG DIHE 1S2 1FE1 1FE2 2SG DIHE 1S3 1FE4 1FE2 2SG DIHE 1S3 1FE3 1FE2 2SG DIHE 1S3 1FE1 1FE2 2SG DIHE 1S4 1FE3 1FE2 2SG DIHE 1S4 1FE2 2SG 2CB DIHE 1S4 1FE4 1FE2 2SG PRES F4-3O -0.635126 ! patch for CYS to FE3 of oxidized [4Fe4S] (1-F4O 2-CYS). ATOM 2N NH1 -0.47 ATOM 2HN H 0.31 ATOM 2CA CT1 0.07 ATOM 2HA HB 0.09 ATOM 2CB CT2 -0.82229 ATOM 2HB1 HA 0.342857 ATOM 2HB2 HA 0.342857 ATOM 2SG S -0.49855 DELETE ATOM 2HG1 BOND 1FE3 2SG ANGL 1FE1 1FE3 2SG ANGL 1FE2 1FE3 2SG ANGL 1FE4 1FE3 2SG ANGL 1S2 1FE3 2SG ANGL 1S3 1FE3 2SG ANGL 1S4 1FE3 2SG ANGL 1FE3 2SG 2CB DIHE 1FE1 1FE2 1FE3 2SG DIHE 1FE1 1FE4 1FE3 2SG DIHE 1FE1 1FE3 2SG 2CB DIHE 1FE1 1S2 1FE3 2SG DIHE 1FE1 1S3 1FE3 2SG DIHE 1FE2 1FE1 1FE3 2SG DIHE 1FE2 1FE3 2SG 2CB DIHE 1FE2 1FE4 1FE3 2SG DIHE 1FE2 1S2 1FE3 2SG DIHE 1FE2 1S4 1FE3 2SG DIHE 1FE3 2SG 2CB 2HB1 DIHE 1FE3 2SG 2CB 2HB2 DIHE 1FE4 1FE1 1FE3 2SG DIHE 1FE4 1FE2 1FE3 2SG DIHE 1FE4 1FE3 2SG 2CB DIHE 1FE4 1S3 1FE3 2SG DIHE 1FE4 1S4 1FE3 2SG DIHE 1S1 1FE1 1FE3 2SG DIHE 1S1 1FE2 1FE3 2SG DIHE 1S1 1FE4 1FE3 2SG DIHE 1S2 1FE1 1FE3 2SG DIHE 1S2 1FE2 1FE3 2SG DIHE 1S2 1FE3 2SG 2CB DIHE 1S3 1FE1 1FE3 2SG DIHE 1S3 1FE3 2SG 2CB DIHE 1S3 1FE4 1FE3 2SG DIHE 1S4 1FE2 1FE3 2SG DIHE 1S4 1FE3 2SG 2CB DIHE 1S4 1FE4 1FE3 2SG PRES F4-4O -0.635126 ! patch for CYS to FE4 of oxidized [4Fe4S] (1-F4O 2-CYS). ATOM 2N NH1 -0.47 ATOM 2HN H 0.31 ATOM 2CA CT1 0.07 ATOM 2HA HB 0.09 ATOM 2CB CT2 -0.82229 ATOM 2HB1 HA 0.342857 ATOM 2HB2 HA 0.342857 ATOM 2SG S -0.49855 DELETE ATOM 2HG1 BOND 1FE4 2SG ANGL 1FE1 1FE4 2SG ANGL 1FE2 1FE4 2SG ANGL 1FE3 1FE4 2SG ANGL 1S1 1FE4 2SG ANGL 1S3 1FE4 2SG ANGL 1S4 1FE4 2SG ANGL 1FE4 2SG 2CB DIHE 1FE1 1FE2 1FE4 2SG DIHE 1FE1 1FE3 1FE4 2SG DIHE 1FE1 1FE4 2SG 2CB DIHE 1FE1 1S1 1FE4 2SG DIHE 1FE1 1S3 1FE4 2SG DIHE 1FE2 1FE1 1FE4 2SG DIHE 1FE2 1FE3 1FE4 2SG DIHE 1FE2 1FE4 2SG 2CB DIHE 1FE2 1S1 1FE4 2SG DIHE 1FE2 1S4 1FE4 2SG DIHE 1FE3 1FE1 1FE4 2SG DIHE 1FE3 1FE2 1FE4 2SG DIHE 1FE3 1FE4 2SG 2CB DIHE 1FE3 1S3 1FE4 2SG DIHE 1FE3 1S4 1FE4 2SG DIHE 1FE4 2SG 2CB 2HB1 DIHE 1FE4 2SG 2CB 2HB2 DIHE 1S1 1FE1 1FE4 2SG DIHE 1S1 1FE2 1FE4 2SG DIHE 1S1 1FE4 2SG 2CB DIHE 1S2 1FE1 1FE4 2SG DIHE 1S2 1FE2 1FE4 2SG DIHE 1S2 1FE3 1FE4 2SG DIHE 1S3 1FE1 1FE4 2SG DIHE 1S3 1FE3 1FE4 2SG DIHE 1S3 1FE4 2SG 2CB DIHE 1S4 1FE2 1FE4 2SG DIHE 1S4 1FE3 1FE4 2SG DIHE 1S4 1FE4 2SG 2CB PRES F4-1R -0.77984 ! patch for CYS to FE1 of reduced [4Fe4S] (1-F4R 2-CYS). ! Total cysteinate charge -0.6539 ATOM 2N NH1 -0.47 ATOM 2HN H 0.31 ATOM 2CA CT1 0.07 ATOM 2HA HB 0.09 ATOM 2CB CT2 -0.82048 ATOM 2HB1 HA 0.32061 ATOM 2HB2 HA 0.32061 ATOM 2SG S -0.60058 DELETE ATOM 2HG1 BOND 1FE1 2SG ANGL 1FE2 1FE1 2SG ANGL 1FE3 1FE1 2SG ANGL 1FE4 1FE1 2SG ANGL 1S1 1FE1 2SG ANGL 1S2 1FE1 2SG ANGL 1S3 1FE1 2SG ANGL 1FE1 2SG 2CB DIHE 1FE1 2SG 2CB 2HB1 DIHE 1FE1 2SG 2CB 2HB2 DIHE 1FE2 1FE1 2SG 2CB DIHE 1FE2 1FE3 1FE1 2SG DIHE 1FE2 1FE4 1FE1 2SG DIHE 1FE2 1S1 1FE1 2SG DIHE 1FE2 1S2 1FE1 2SG DIHE 1FE3 1FE1 2SG 2CB DIHE 1FE3 1FE2 1FE1 2SG DIHE 1FE3 1FE4 1FE1 2SG DIHE 1FE3 1S2 1FE1 2SG DIHE 1FE3 1S3 1FE1 2SG DIHE 1FE4 1FE1 2SG 2CB DIHE 1FE4 1FE2 1FE1 2SG DIHE 1FE4 1FE3 1FE1 2SG DIHE 1FE4 1S1 1FE1 2SG DIHE 1FE4 1S3 1FE1 2SG DIHE 1S1 1FE2 1FE1 2SG DIHE 1S1 1FE4 1FE1 2SG DIHE 1S1 1FE1 2SG 2CB DIHE 1S2 1FE2 1FE1 2SG DIHE 1S2 1FE3 1FE1 2SG DIHE 1S2 1FE1 2SG 2CB DIHE 1S3 1FE3 1FE1 2SG DIHE 1S3 1FE4 1FE1 2SG DIHE 1S3 1FE1 2SG 2CB DIHE 1S4 1FE2 1FE1 2SG DIHE 1S4 1FE3 1FE1 2SG DIHE 1S4 1FE4 1FE1 2SG PRES F4-2R -0.77984 ! patch for CYS to FE2 of reduced [4Fe4S] (1-F4R 2-CYS). ! Total cysteinate charge -0.6539 ATOM 2N NH1 -0.47 ATOM 2HN H 0.31 ATOM 2CA CT1 0.07 ATOM 2HA HB 0.09 ATOM 2CB CT2 -0.82048 ATOM 2HB1 HA 0.32061 ATOM 2HB2 HA 0.32061 ATOM 2SG S -0.60058 DELETE ATOM 2HG1 BOND 1FE2 2SG ANGL 1FE1 1FE2 2SG ANGL 1FE3 1FE2 2SG ANGL 1FE4 1FE2 2SG ANGL 1S1 1FE2 2SG ANGL 1S2 1FE2 2SG ANGL 1S4 1FE2 2SG ANGL 1FE2 2SG 2CB DIHE 1FE1 1FE2 2SG 2CB DIHE 1FE1 1FE3 1FE2 2SG DIHE 1FE1 1FE4 1FE2 2SG DIHE 1FE1 1S1 1FE2 2SG DIHE 1FE1 1S2 1FE2 2SG DIHE 1FE2 2SG 2CB 2HB1 DIHE 1FE2 2SG 2CB 2HB2 DIHE 1FE3 1FE1 1FE2 2SG DIHE 1FE3 1FE2 2SG 2CB DIHE 1FE3 1FE4 1FE2 2SG DIHE 1FE3 1S2 1FE2 2SG DIHE 1FE3 1S4 1FE2 2SG DIHE 1FE4 1FE1 1FE2 2SG DIHE 1FE4 1FE2 2SG 2CB DIHE 1FE4 1FE3 1FE2 2SG DIHE 1FE4 1S1 1FE2 2SG DIHE 1FE4 1S4 1FE2 2SG DIHE 1S1 1FE4 1FE2 2SG DIHE 1S1 1FE1 1FE2 2SG DIHE 1S1 1FE2 2SG 2CB DIHE 1S2 1FE2 2SG 2CB DIHE 1S2 1FE3 1FE2 2SG DIHE 1S2 1FE1 1FE2 2SG DIHE 1S3 1FE4 1FE2 2SG DIHE 1S3 1FE3 1FE2 2SG DIHE 1S3 1FE1 1FE2 2SG DIHE 1S4 1FE3 1FE2 2SG DIHE 1S4 1FE2 2SG 2CB DIHE 1S4 1FE4 1FE2 2SG PRES F4-3R -0.77984 ! patch for CYS to FE3 of reduced [4Fe4S] (1-F4R 2-CYS). ! Total cysteinate charge -0.6539 ATOM 2N NH1 -0.47 ATOM 2HN H 0.31 ATOM 2CA CT1 0.07 ATOM 2HA HB 0.09 ATOM 2CB CT2 -0.82048 ATOM 2HB1 HA 0.32061 ATOM 2HB2 HA 0.32061 ATOM 2SG S -0.60058 DELETE ATOM 2HG1 BOND 1FE3 2SG ANGL 1FE1 1FE3 2SG ANGL 1FE2 1FE3 2SG ANGL 1FE4 1FE3 2SG ANGL 1S2 1FE3 2SG ANGL 1S3 1FE3 2SG ANGL 1S4 1FE3 2SG ANGL 1FE3 2SG 2CB DIHE 1FE1 1FE2 1FE3 2SG DIHE 1FE1 1FE4 1FE3 2SG DIHE 1FE1 1FE3 2SG 2CB DIHE 1FE1 1S2 1FE3 2SG DIHE 1FE1 1S3 1FE3 2SG DIHE 1FE2 1FE1 1FE3 2SG DIHE 1FE2 1FE3 2SG 2CB DIHE 1FE2 1FE4 1FE3 2SG DIHE 1FE2 1S2 1FE3 2SG DIHE 1FE2 1S4 1FE3 2SG DIHE 1FE3 2SG 2CB 2HB1 DIHE 1FE3 2SG 2CB 2HB2 DIHE 1FE4 1FE1 1FE3 2SG DIHE 1FE4 1FE2 1FE3 2SG DIHE 1FE4 1FE3 2SG 2CB DIHE 1FE4 1S3 1FE3 2SG DIHE 1FE4 1S4 1FE3 2SG DIHE 1S1 1FE1 1FE3 2SG DIHE 1S1 1FE2 1FE3 2SG DIHE 1S1 1FE4 1FE3 2SG DIHE 1S2 1FE1 1FE3 2SG DIHE 1S2 1FE2 1FE3 2SG DIHE 1S2 1FE3 2SG 2CB DIHE 1S3 1FE1 1FE3 2SG DIHE 1S3 1FE3 2SG 2CB DIHE 1S3 1FE4 1FE3 2SG DIHE 1S4 1FE2 1FE3 2SG DIHE 1S4 1FE3 2SG 2CB DIHE 1S4 1FE4 1FE3 2SG PRES F4-4R -0.77984 ! patch for CYS to FE4 of reduced [4Fe4S] (1-F4R 2-CYS). ! Total cysteinate charge -0.6539 ATOM 2N NH1 -0.47 ATOM 2HN H 0.31 ATOM 2CA CT1 0.07 ATOM 2HA HB 0.09 ATOM 2CB CT2 -0.82048 ATOM 2HB1 HA 0.32061 ATOM 2HB2 HA 0.32061 ATOM 2SG S -0.60058 DELETE ATOM 2HG1 BOND 1FE4 2SG ANGL 1FE1 1FE4 2SG ANGL 1FE2 1FE4 2SG ANGL 1FE3 1FE4 2SG ANGL 1S1 1FE4 2SG ANGL 1S3 1FE4 2SG ANGL 1S4 1FE4 2SG ANGL 1FE4 2SG 2CB DIHE 1FE1 1FE2 1FE4 2SG DIHE 1FE1 1FE3 1FE4 2SG DIHE 1FE1 1S1 1FE4 2SG DIHE 1FE1 1S3 1FE4 2SG DIHE 1FE2 1FE1 1FE4 2SG DIHE 1FE2 1FE3 1FE4 2SG DIHE 1FE2 1FE4 2SG 2CB DIHE 1FE2 1S1 1FE4 2SG DIHE 1FE2 1S4 1FE4 2SG DIHE 1FE3 1FE1 1FE4 2SG DIHE 1FE3 1FE2 1FE4 2SG DIHE 1FE3 1FE4 2SG 2CB DIHE 1FE3 1S3 1FE4 2SG DIHE 1FE3 1S4 1FE4 2SG DIHE 1FE4 2SG 2CB 2HB1 DIHE 1FE4 2SG 2CB 2HB2 DIHE 1S1 1FE1 1FE4 2SG DIHE 1S1 1FE2 1FE4 2SG DIHE 1S1 1FE4 2SG 2CB DIHE 1S2 1FE1 1FE4 2SG DIHE 1S2 1FE2 1FE4 2SG DIHE 1S2 1FE3 1FE4 2SG DIHE 1S3 1FE1 1FE4 2SG DIHE 1S3 1FE3 1FE4 2SG DIHE 1S3 1FE4 2SG 2CB DIHE 1S4 1FE2 1FE4 2SG DIHE 1S4 1FE3 1FE4 2SG DIHE 1S4 1FE4 2SG 2CB PRES FHO-1H 0.07433 ! Patch to ligate Fe1 to NE2 of HSD-ligated oxidized [4Fe-4S] cluster (1-FHO 2-HSD) ATOM 2N NH1 -0.47 ATOM 2HN H 0.31 ATOM 2CA CT1 0.07 ATOM 2HA HB 0.09 ATOM 2CB CT2 -0.70937 ATOM 2HB1 HA 0.37533 ATOM 2HB2 HA 0.37533 ATOM 2ND1 NR1 -0.56083 ATOM 2HD1 H 0.43762 ATOM 2CG CPH1 0.08468 ATOM 2CE1 CPH2 0.15479 ATOM 2HE1 HR1 0.24623 ATOM 2NE2 NR2 -0.50194 ATOM 2CD2 CPH1 -0.08168 ATOM 2HD2 HR3 0.25417 BOND 1FE1 2NE2 ANGL 1FE2 1FE1 2NE2 ANGL 1FE3 1FE1 2NE2 ANGL 1FE4 1FE1 2NE2 ANGL 1S1 1FE1 2NE2 ANGL 1S2 1FE1 2NE2 ANGL 1S3 1FE1 2NE2 ANGL 1FE1 2NE2 2CD2 ANGL 1FE1 2NE2 2CE1 DIHE 1FE1 2NE2 2CD2 2CG DIHE 1FE1 2NE2 2CD2 2HD2 DIHE 1FE1 2NE2 2CE1 2HE1 DIHE 1FE1 2NE2 2CE1 2ND1 DIHE 1FE2 1FE1 2NE2 2CD2 DIHE 1FE2 1FE1 2NE2 2CE1 DIHE 1FE2 1FE3 1FE1 2NE2 DIHE 1FE2 1FE4 1FE1 2NE2 DIHE 1FE2 1S1 1FE1 2NE2 DIHE 1FE2 1S2 1FE1 2NE2 DIHE 1FE3 1FE1 2NE2 2CD2 DIHE 1FE3 1FE1 2NE2 2CE1 DIHE 1FE3 1FE2 1FE1 2NE2 DIHE 1FE3 1FE4 1FE1 2NE2 DIHE 1FE3 1S2 1FE1 2NE2 DIHE 1FE3 1S3 1FE1 2NE2 DIHE 1FE4 1FE1 2NE2 2CD2 DIHE 1FE4 1FE1 2NE2 2CE1 DIHE 1FE4 1FE2 1FE1 2NE2 DIHE 1FE4 1FE3 1FE1 2NE2 DIHE 1FE4 1S1 1FE1 2NE2 DIHE 1FE4 1S3 1FE1 2NE2 DIHE 1S1 1FE1 2NE2 2CD2 DIHE 1S1 1FE1 2NE2 2CE1 DIHE 1S1 1FE2 1FE1 2NE2 DIHE 1S1 1FE4 1FE1 2NE2 DIHE 1S2 1FE1 2NE2 2CD2 DIHE 1S2 1FE1 2NE2 2CE1 DIHE 1S2 1FE2 1FE1 2NE2 DIHE 1S2 1FE3 1FE1 2NE2 DIHE 1S3 1FE1 2NE2 2CD2 DIHE 1S3 1FE1 2NE2 2CE1 DIHE 1S3 1FE3 1FE1 2NE2 DIHE 1S3 1FE4 1FE1 2NE2 DIHE 1S4 1FE2 1FE1 2NE2 DIHE 1S4 1FE3 1FE1 2NE2 DIHE 1S4 1FE4 1FE1 2NE2 PRES FHO-2C -0.34763 ! Patch to ligate Fe2 to SG of HSD-ligated oxidized [4Fe-4S] cluster (1-FHO 2-HSD) ATOM 2N NH1 -0.47 ATOM 2HN H 0.31 ATOM 2CA CT1 0.07 ATOM 2HA HB 0.09 ATOM 2CB CT2 -0.81732 ATOM 2HB1 HA 0.34788 ATOM 2HB2 HA 0.34788 ATOM 2SG S -0.22607 DELETE ATOM 2HG1 BOND 1FE2 2SG ANGL 1FE1 1FE2 2SG ANGL 1FE3 1FE2 2SG ANGL 1FE4 1FE2 2SG ANGL 1S1 1FE2 2SG ANGL 1S2 1FE2 2SG ANGL 1S4 1FE2 2SG ANGL 1FE2 2SG 2CB DIHE 1FE1 1FE2 2SG 2CB DIHE 1FE1 1FE3 1FE2 2SG DIHE 1FE1 1FE4 1FE2 2SG DIHE 1FE1 1S1 1FE2 2SG DIHE 1FE1 1S2 1FE2 2SG DIHE 1FE2 2SG 2CB 2HB1 DIHE 1FE2 2SG 2CB 2HB2 DIHE 1FE3 1FE1 1FE2 2SG DIHE 1FE3 1FE2 2SG 2CB DIHE 1FE3 1FE4 1FE2 2SG DIHE 1FE3 1S2 1FE2 2SG DIHE 1FE3 1S4 1FE2 2SG DIHE 1FE4 1FE1 1FE2 2SG DIHE 1FE4 1FE2 2SG 2CB DIHE 1FE4 1FE3 1FE2 2SG DIHE 1FE4 1S1 1FE2 2SG DIHE 1FE4 1S4 1FE2 2SG DIHE 1S1 1FE4 1FE2 2SG DIHE 1S1 1FE1 1FE2 2SG DIHE 1S1 1FE2 2SG 2CB DIHE 1S2 1FE2 2SG 2CB DIHE 1S2 1FE3 1FE2 2SG DIHE 1S2 1FE1 1FE2 2SG DIHE 1S3 1FE4 1FE2 2SG DIHE 1S3 1FE3 1FE2 2SG DIHE 1S3 1FE1 1FE2 2SG DIHE 1S4 1FE3 1FE2 2SG DIHE 1S4 1FE2 2SG 2CB DIHE 1S4 1FE4 1FE2 2SG PRES FHO-3C -0.34763 ! Patch to ligate Fe3 to SG of HSD-ligated oxidized [4Fe-4S] cluster (1-FHO 2-HSD) ATOM 2N NH1 -0.47 ATOM 2HN H 0.31 ATOM 2CA CT1 0.07 ATOM 2HA HB 0.09 ATOM 2CB CT2 -0.81732 ATOM 2HB1 HA 0.34788 ATOM 2HB2 HA 0.34788 ATOM 2SG S -0.22607 DELETE ATOM 2HG1 BOND 1FE3 2SG ANGL 1FE1 1FE3 2SG ANGL 1FE2 1FE3 2SG ANGL 1FE4 1FE3 2SG ANGL 1S2 1FE3 2SG ANGL 1S3 1FE3 2SG ANGL 1S4 1FE3 2SG ANGL 1FE3 2SG 2CB DIHE 1FE1 1FE2 1FE3 2SG DIHE 1FE1 1FE4 1FE3 2SG DIHE 1FE1 1FE3 2SG 2CB DIHE 1FE1 1S2 1FE3 2SG DIHE 1FE1 1S3 1FE3 2SG DIHE 1FE2 1FE1 1FE3 2SG DIHE 1FE2 1FE3 2SG 2CB DIHE 1FE2 1FE4 1FE3 2SG DIHE 1FE2 1S2 1FE3 2SG DIHE 1FE2 1S4 1FE3 2SG DIHE 1FE3 2SG 2CB 2HB1 DIHE 1FE3 2SG 2CB 2HB2 DIHE 1FE4 1FE1 1FE3 2SG DIHE 1FE4 1FE2 1FE3 2SG DIHE 1FE4 1FE3 2SG 2CB DIHE 1FE4 1S3 1FE3 2SG DIHE 1FE4 1S4 1FE3 2SG DIHE 1S1 1FE1 1FE3 2SG DIHE 1S1 1FE2 1FE3 2SG DIHE 1S1 1FE4 1FE3 2SG DIHE 1S2 1FE1 1FE3 2SG DIHE 1S2 1FE2 1FE3 2SG DIHE 1S2 1FE3 2SG 2CB DIHE 1S3 1FE1 1FE3 2SG DIHE 1S3 1FE3 2SG 2CB DIHE 1S3 1FE4 1FE3 2SG DIHE 1S4 1FE2 1FE3 2SG DIHE 1S4 1FE3 2SG 2CB DIHE 1S4 1FE4 1FE3 2SG PRES FHO-4C -0.34763 ! Patch to ligate Fe4 to SG of HSD-ligated oxidized [4Fe-4S] cluster (1-FHO 2-HSD) ATOM 2N NH1 -0.47 ATOM 2HN H 0.31 ATOM 2CA CT1 0.07 ATOM 2HA HB 0.09 ATOM 2CB CT2 -0.81732 ATOM 2HB1 HA 0.34788 ATOM 2HB2 HA 0.34788 ATOM 2SG S -0.22607 DELETE ATOM 2HG1 BOND 1FE4 2SG ANGL 1FE1 1FE4 2SG ANGL 1FE2 1FE4 2SG ANGL 1FE3 1FE4 2SG ANGL 1S1 1FE4 2SG ANGL 1S3 1FE4 2SG ANGL 1S4 1FE4 2SG ANGL 1FE4 2SG 2CB DIHE 1FE1 1FE2 1FE4 2SG DIHE 1FE1 1FE3 1FE4 2SG DIHE 1FE1 1S1 1FE4 2SG DIHE 1FE1 1S3 1FE4 2SG DIHE 1FE2 1FE1 1FE4 2SG DIHE 1FE2 1FE3 1FE4 2SG DIHE 1FE2 1FE4 2SG 2CB DIHE 1FE2 1S1 1FE4 2SG DIHE 1FE2 1S4 1FE4 2SG DIHE 1FE3 1FE1 1FE4 2SG DIHE 1FE3 1FE2 1FE4 2SG DIHE 1FE3 1FE4 2SG 2CB DIHE 1FE3 1S3 1FE4 2SG DIHE 1FE3 1S4 1FE4 2SG DIHE 1FE4 2SG 2CB 2HB1 DIHE 1FE4 2SG 2CB 2HB2 DIHE 1S1 1FE1 1FE4 2SG DIHE 1S1 1FE2 1FE4 2SG DIHE 1S1 1FE4 2SG 2CB DIHE 1S2 1FE1 1FE4 2SG DIHE 1S2 1FE2 1FE4 2SG DIHE 1S2 1FE3 1FE4 2SG DIHE 1S3 1FE1 1FE4 2SG DIHE 1S3 1FE3 1FE4 2SG DIHE 1S3 1FE4 2SG 2CB DIHE 1S4 1FE2 1FE4 2SG DIHE 1S4 1FE3 1FE4 2SG DIHE 1S4 1FE4 2SG 2CB PRES FHR-1H 0.07447 ! Patch to ligate Fe1 to NE2 of HSD-ligated reduced [4Fe-4S] cluster (1-FHO 2-HSD) ATOM 2N NH1 -0.47 ATOM 2HN H 0.31 ATOM 2CA CT1 0.07 ATOM 2HA HB 0.09 ATOM 2CB CT2 -0.70782 ATOM 2HB1 HA 0.36806 ATOM 2HB2 HA 0.36806 ATOM 2ND1 NR1 -0.57492 ATOM 2HD1 H 0.43578 ATOM 2CG CPH1 0.07095 ATOM 2CE1 CPH2 0.21149 ATOM 2HE1 HR1 0.26477 ATOM 2NE2 NR2 -0.56809 ATOM 2CD2 CPH1 -0.05102 ATOM 2HD2 HR3 0.25721 BOND 1FE1 2NE2 ANGL 1FE2 1FE1 2NE2 ANGL 1FE3 1FE1 2NE2 ANGL 1FE4 1FE1 2NE2 ANGL 1S1 1FE1 2NE2 ANGL 1S2 1FE1 2NE2 ANGL 1S3 1FE1 2NE2 ANGL 1FE1 2NE2 2CD2 ANGL 1FE1 2NE2 2CE1 DIHE 1FE1 2NE2 2CD2 2CG DIHE 1FE1 2NE2 2CD2 2HD2 DIHE 1FE1 2NE2 2CE1 2HE1 DIHE 1FE1 2NE2 2CE1 2ND1 DIHE 1FE2 1FE1 2NE2 2CD2 DIHE 1FE2 1FE1 2NE2 2CE1 DIHE 1FE2 1FE3 1FE1 2NE2 DIHE 1FE2 1FE4 1FE1 2NE2 DIHE 1FE2 1S1 1FE1 2NE2 DIHE 1FE2 1S2 1FE1 2NE2 DIHE 1FE3 1FE1 2NE2 2CD2 DIHE 1FE3 1FE1 2NE2 2CE1 DIHE 1FE3 1FE2 1FE1 2NE2 DIHE 1FE3 1FE4 1FE1 2NE2 DIHE 1FE3 1S2 1FE1 2NE2 DIHE 1FE3 1S3 1FE1 2NE2 DIHE 1FE4 1FE1 2NE2 2CD2 DIHE 1FE4 1FE1 2NE2 2CE1 DIHE 1FE4 1FE2 1FE1 2NE2 DIHE 1FE4 1FE3 1FE1 2NE2 DIHE 1FE4 1S1 1FE1 2NE2 DIHE 1FE4 1S3 1FE1 2NE2 DIHE 1S1 1FE1 2NE2 2CD2 DIHE 1S1 1FE1 2NE2 2CE1 DIHE 1S1 1FE2 1FE1 2NE2 DIHE 1S1 1FE4 1FE1 2NE2 DIHE 1S2 1FE1 2NE2 2CD2 DIHE 1S2 1FE1 2NE2 2CE1 DIHE 1S2 1FE2 1FE1 2NE2 DIHE 1S2 1FE3 1FE1 2NE2 DIHE 1S3 1FE1 2NE2 2CD2 DIHE 1S3 1FE1 2NE2 2CE1 DIHE 1S3 1FE3 1FE1 2NE2 DIHE 1S3 1FE4 1FE1 2NE2 DIHE 1S4 1FE2 1FE1 2NE2 DIHE 1S4 1FE3 1FE1 2NE2 DIHE 1S4 1FE4 1FE1 2NE2 PRES FHR-2C -0.61229 ! Patch to ligate Fe2 to SG of HSD-ligated reduced [4Fe-4S] cluster (1-FHR 2-HSD) ATOM 2N NH1 -0.47 ATOM 2HN H 0.31 ATOM 2CA CT1 0.07 ATOM 2HA HB 0.09 ATOM 2CB CT2 -0.82155 ATOM 2HB1 HA 0.33762 ATOM 2HB2 HA 0.33762 ATOM 2SG S -0.46598 DELETE ATOM 2HG1 BOND 1FE2 2SG ANGL 1FE1 1FE2 2SG ANGL 1FE3 1FE2 2SG ANGL 1FE4 1FE2 2SG ANGL 1S1 1FE2 2SG ANGL 1S2 1FE2 2SG ANGL 1S4 1FE2 2SG ANGL 1FE2 2SG 2CB DIHE 1FE1 1FE2 2SG 2CB DIHE 1FE1 1FE3 1FE2 2SG DIHE 1FE1 1FE4 1FE2 2SG DIHE 1FE1 1S1 1FE2 2SG DIHE 1FE1 1S2 1FE2 2SG DIHE 1FE2 2SG 2CB 2HB1 DIHE 1FE2 2SG 2CB 2HB2 DIHE 1FE3 1FE1 1FE2 2SG DIHE 1FE3 1FE2 2SG 2CB DIHE 1FE3 1FE4 1FE2 2SG DIHE 1FE3 1S2 1FE2 2SG DIHE 1FE3 1S4 1FE2 2SG DIHE 1FE4 1FE1 1FE2 2SG DIHE 1FE4 1FE2 2SG 2CB DIHE 1FE4 1FE3 1FE2 2SG DIHE 1FE4 1S1 1FE2 2SG DIHE 1FE4 1S4 1FE2 2SG DIHE 1S1 1FE4 1FE2 2SG DIHE 1S1 1FE1 1FE2 2SG DIHE 1S1 1FE2 2SG 2CB DIHE 1S2 1FE2 2SG 2CB DIHE 1S2 1FE3 1FE2 2SG DIHE 1S2 1FE1 1FE2 2SG DIHE 1S3 1FE4 1FE2 2SG DIHE 1S3 1FE3 1FE2 2SG DIHE 1S3 1FE1 1FE2 2SG DIHE 1S4 1FE3 1FE2 2SG DIHE 1S4 1FE2 2SG 2CB DIHE 1S4 1FE4 1FE2 2SG PRES FHR-3C -0.61229 ! Patch to ligate Fe3 to SG of HSD-ligated reduced [4Fe-4S] cluster (1-FHR 2-HSD) ATOM 2N NH1 -0.47 ATOM 2HN H 0.31 ATOM 2CA CT1 0.07 ATOM 2HA HB 0.09 ATOM 2CB CT2 -0.82155 ATOM 2HB1 HA 0.33762 ATOM 2HB2 HA 0.33762 ATOM 2SG S -0.46598 DELETE ATOM 2HG1 BOND 1FE3 2SG ANGL 1FE1 1FE3 2SG ANGL 1FE2 1FE3 2SG ANGL 1FE4 1FE3 2SG ANGL 1S2 1FE3 2SG ANGL 1S3 1FE3 2SG ANGL 1S4 1FE3 2SG ANGL 1FE3 2SG 2CB DIHE 1FE1 1FE2 1FE3 2SG DIHE 1FE1 1FE4 1FE3 2SG DIHE 1FE1 1FE3 2SG 2CB DIHE 1FE1 1S2 1FE3 2SG DIHE 1FE1 1S3 1FE3 2SG DIHE 1FE2 1FE1 1FE3 2SG DIHE 1FE2 1FE3 2SG 2CB DIHE 1FE2 1FE4 1FE3 2SG DIHE 1FE2 1S2 1FE3 2SG DIHE 1FE2 1S4 1FE3 2SG DIHE 1FE3 2SG 2CB 2HB1 DIHE 1FE3 2SG 2CB 2HB2 DIHE 1FE4 1FE1 1FE3 2SG DIHE 1FE4 1FE2 1FE3 2SG DIHE 1FE4 1FE3 2SG 2CB DIHE 1FE4 1S3 1FE3 2SG DIHE 1FE4 1S4 1FE3 2SG DIHE 1S1 1FE1 1FE3 2SG DIHE 1S1 1FE2 1FE3 2SG DIHE 1S1 1FE4 1FE3 2SG DIHE 1S2 1FE1 1FE3 2SG DIHE 1S2 1FE2 1FE3 2SG DIHE 1S2 1FE3 2SG 2CB DIHE 1S3 1FE1 1FE3 2SG DIHE 1S3 1FE3 2SG 2CB DIHE 1S3 1FE4 1FE3 2SG DIHE 1S4 1FE2 1FE3 2SG DIHE 1S4 1FE3 2SG 2CB DIHE 1S4 1FE4 1FE3 2SG PRES FHR-4C -0.61229 ! Patch to ligate Fe4 to SG of HSD-ligated reduced [4Fe-4S] cluster (1-FHR 2-HSD) ATOM 2N NH1 -0.47 ATOM 2HN H 0.31 ATOM 2CA CT1 0.07 ATOM 2HA HB 0.09 ATOM 2CB CT2 -0.82155 ATOM 2HB1 HA 0.33762 ATOM 2HB2 HA 0.33762 ATOM 2SG S -0.46598 DELETE ATOM 2HG1 BOND 1FE4 2SG ANGL 1FE1 1FE4 2SG ANGL 1FE2 1FE4 2SG ANGL 1FE3 1FE4 2SG ANGL 1S1 1FE4 2SG ANGL 1S3 1FE4 2SG ANGL 1S4 1FE4 2SG ANGL 1FE4 2SG 2CB DIHE 1FE1 1FE2 1FE4 2SG DIHE 1FE1 1FE3 1FE4 2SG DIHE 1FE1 1S1 1FE4 2SG DIHE 1FE1 1S3 1FE4 2SG DIHE 1FE2 1FE1 1FE4 2SG DIHE 1FE2 1FE3 1FE4 2SG DIHE 1FE2 1FE4 2SG 2CB DIHE 1FE2 1S1 1FE4 2SG DIHE 1FE2 1S4 1FE4 2SG DIHE 1FE3 1FE1 1FE4 2SG DIHE 1FE3 1FE2 1FE4 2SG DIHE 1FE3 1FE4 2SG 2CB DIHE 1FE3 1S3 1FE4 2SG DIHE 1FE3 1S4 1FE4 2SG DIHE 1FE4 2SG 2CB 2HB1 DIHE 1FE4 2SG 2CB 2HB2 DIHE 1S1 1FE1 1FE4 2SG DIHE 1S1 1FE2 1FE4 2SG DIHE 1S1 1FE4 2SG 2CB DIHE 1S2 1FE1 1FE4 2SG DIHE 1S2 1FE2 1FE4 2SG DIHE 1S2 1FE3 1FE4 2SG DIHE 1S3 1FE1 1FE4 2SG DIHE 1S3 1FE3 1FE4 2SG DIHE 1S3 1FE4 2SG 2CB DIHE 1S4 1FE2 1FE4 2SG DIHE 1S4 1FE3 1FE4 2SG DIHE 1S4 1FE4 2SG 2CB PRES HCB ! patch to bond bridging CYS to FE1 of H-Cluster (1-HCR 2-CYS). Must apply this after F4-X-type patch! BOND 1FE1 2SG ANGLE 2SG 1FE1 1S1 2SG 1FE1 1S2 1FE2 1FE1 2SG ANGLE 1FE1 2SG 2CB 2SG 1FE1 1C4 2SG 1FE1 1C3 IMPR 2SG 1S1 1FE1 1C5 1S1 1FE1 2SG 1C3 END